Multimodal subtypes identified in Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative participants by missing-data-enabled subtype and stage inference
Notice bibliographique
Résumé
Alzheimer's disease is a highly heterogeneous disease in which different biomarkers are dynamic over different windows of the decades-long pathophysiological processes, and potentially have distinct involvement in different subgroups. Subtype and Stage Inference is an unsupervised learning algorithm that disentangles the phenotypic heterogeneity and temporal progression of disease biomarkers, providing disease insight and quantitative estimates of individual subtype and stage. However, a key limitation of Subtype and Stage Inference is that it requires a complete set of biomarkers for each subject, reducing the number of datapoints available for model fitting and limiting applications of Subtype and Stage Inference to modalities that are widely collected, e.g. volumetric biomarkers derived from structural MRI. In this study, we adapted the Subtype and Stage Inference algorithm to handle missing data, enabling the application of Subtype and Stage Inference to multimodal data (magnetic resonance imaging, positron emission tomography, cerebrospinal fluid and cognitive tests) from 789 participants in the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative. Missing-data Subtype and Stage Inference identified five subtypes having distinct progression patterns, which we describe by the earliest unique abnormality as 'Typical AD with Early Tau', 'Typical AD with Late Tau', 'Cortical', 'Cognitive' and 'Subcortical'. These new multimodal subtypes were differentially associated with age, years of education, Apolipoprotein E (APOE4) status, white matter hyperintensity burden and the rate of conversion from mild cognitive impairment to Alzheimer's disease, with the 'Cognitive' subtype showing the fastest clinical progression, and the 'Subcortical' subtype the slowest. Overall, we demonstrate that missing-data Subtype and Stage Inference reveals a finer landscape of Alzheimer's disease subtypes, each of which are associated with different risk factors. Missing-data Subtype and Stage Inference has broad utility, enabling the prediction of progression in a much wider set of individuals, rather than being restricted to those with complete data.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».