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Enregistrement W4400024433 · doi:10.17615/q54q-w544

Germline determinants of humoral immune response to HPV-16 protect against oropharyngeal cancer

2024· article· en· W4400024433 sur OpenAlexfundno aff
Franco Merletti, Bo T. Hansen, Gabriella Cadoni, Geoffrey Liu, Andrew F. Olshan, Rolando Herrero, Sylvia Wright, Wolfgang Ahrens, Daniela Mariosa, Areti Lagiou, Noemi Bender, Shama Virani, D. Neil Hayes, Aida Ferreiro-Iglesias, Christopher I. Amos, Tim Waterboer, Stefania Boccia, Corina Lesseur, Antonio Agudo, David I. Conway, Karl Smith-Byrne, Mattias Johansson, N. Brenner, Virginia Díez‐Obrero, Michael B. Robinson, Mari Nygård, Michael Pawlita, Martin Lacko, Paul Brennan, Tatiana V. Macfarlane, Miranda Pring, Jerry Polesel, Παγώνα Λάγιου, Beatriz Kanterewicz, Ivana Holcátová, Marko Milojević, Robert L. Ferris, Tom Dudding, Ariana Znaor, Valérie Gaborieau, L. Schroeder, Laia Alemany, Brenda Diergaarde, Andy Ness, Claire M. Healy, Mark C. Weissler, James McKay, Lorenzo Simonato, Yonathan Brhane

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKCanadian Cancer Society Research InstituteCompagnia di San PaoloNational Institute for Health and Care ResearchPrincess Margaret Hospital FoundationEuropean CommissionUniversity of Pittsburgh
Mots-clésImmune systemGermlineImmunologyMedicineBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although several oropharyngeal cancer (OPC) susceptibility loci have been identified, most previous studies lacked detailed information on human papillomavirus (HPV) status. We conduct a genome-wide analysis by HPV16 serology status in 4,002 oral cancer cases (OPC and oral cavity cancer (OCC)) and 5,256 controls. We detect four susceptibility loci pointing to a distinct genetic predisposition by HPV status. Our most notable finding in the HLA region, that is now confirmed to be specific of HPV(+)OPC risk, reveal two independent loci with strong protective effects, one refining the previously reported HLA class II haplotype association. Antibody levels against HPV16 viral proteins strongly implicate the protective HLA variants as major determinants of humoral response against L1 capsid protein or E6 oncoprotein suggesting a natural immune response against HPV(+)OPC promoted by HLA variants. This indicates that therapeutic vaccines that target E6 and attenuate viral response after established HPV infections might protect against HPV(+)OPC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,771
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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