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Enregistrement W4400024441 · doi:10.17615/mt16-xj68

Combined Associations of a Polygenic Risk Score and Classical Risk Factors with Breast Cancer Risk

2024· article· en· W4400024441 sur OpenAlexfundno aff
Nasim Mavaddat, Minouk J. Schoemaker, Hiltrud Brauch, Thomas Brüning, David J. Hunter, Montserrat García‐Closas, Jose E. Castelao, Eunjung Lee, Mikael Eriksson, Xiaohong R. Yang, N. Chatterjee, Kamila Czene, Paul D.P. Pharoah, Andrew Wilcox, Stig E. Bojesen, A. Jung, Cari M. Kitahara, Daniele Campa, Robert J. MacInnis, Pabitra Pal Choudhury, Q. Wang, I.L. Andrulis, Walter C. Willett, Marike Gabrielson, Guillermo Pita, Ben Schöttker, Esther M. John, Trevor Ahearn, Michael E. Jones, Martha S. Linet, Christine L. Clarke, Ross L. Prentice, Kathryn J. Ruddy, Alicia Beeghly‐Fadiel, P.A. Fasching, Yon‐Dschun Ko, Federico Canzian, S.L. Neuhausen, Volker Arndt, Lin Fritschi, John J. Spinelli, Manuela Gago-Domínguez, Mia M. Gaudet, R. Kaaks, Per Hall, Rodney J. Scott, Jane Heyworth, Anna González‐Neira, Elke M. van Veen, J. Benitez, Manjeet K. Bolla, S. M. Gapstur, Paul L. Auer, Joe Dennis, Diether Lambrechts, Melissa C. Southey, Jennifer Stone, Angela Cox, Heiko Becher, Arif B. Ekici, Stacey J. Winham, Zumuruda Abu-Ful, U. Hamann, Xiao‐Ou Shu, Jolanta Lissowska, B. Holleczek, kConFab AOCS Investigators, Robert N. Hoover, Anthony Howell, Laura E. Beane Freeman, Allison W. Kurian, L. Le Marchand, Alicja Wolk, Simon S. Cross, C. Saunders, Alison M. Dunning, William G. Newman, X. Wang, Renske Keeman, Peter Kraft, Qiuyin Cai, Ana Llaneza, Caroline Weltens, Ángel Carracedo, Niclas Håkansson, ABCTB Investigators, John L. Hopper, Jiayu Dai, Ann Smeets, Georgia Chenevix‐Trench, Pascal Guénel, Sara Lindström, Hedy S. Rennert, Argyrios Ziogas, Marı́a Elena Martı́nez, Melissa A. Troester, Clarice R. Weinberg, Aaron D. Norman, D. Gareth Evans, Andrew F. Olshan, Eric C. Polley, D.F. Easton, H. Anton-Culver, Catriona McLean, Brad Carter, Jonine D. Figueroa, G. Rennert, H.S. Earp, Nick Orr, Lothar Haeberle, Sigrid Hatse, Roger L. Milne, Sabine Behrens, Jack A. Taylor, Celine M. Vachon, Chi Gao, Kyriaki Michailidou, Janet E. Olson, Graham G. Giles, F. Lejbkowicz, Håkan Olsson, Fredrick R. Schumacher, Rulla M. Tamimi, C.M. Perou, C.A. Haiman, L. Bernstein, Hermann Brenner, Dale P. Sandler, S.J. Chanock, Anthony J. Swerdlow, F.J. Couch, Christopher G. Scott, Marina Beckmann, A. Heather Eliassen, Stella Koutros, Katie M. O’Brien, Jenny Chang‐Claude, Kristan J. Aronson, Wei Zheng, Taylor Maurer, Marjanka K. Schmidt

Notice bibliographique

RevueEdinburgh Research Explorer (University of Edinburgh) · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfProgramme Grants for Applied ResearchInstituto de Salud Carlos IIICancer Council TasmaniaNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilInstitut National Du CancerCenters for Disease Control and PreventionHellenic Health FoundationRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnInstitut Gustave-RoussyDeutsche KrebshilfeSwedish Cancer FoundationAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailVetenskapsrådetBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCancer AustraliaAgence Nationale de la RechercheBreast Cancer Research FoundationMcGill UniversityDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungGentofte HospitalDeutsche ForschungsgemeinschaftCancer Council South AustraliaFonds Wetenschappelijk OnderzoekCancerfondenNational Cancer InstituteCancer Institute NSWNational Breast Cancer FoundationUniversity of CambridgeCancer Research UKDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroLon V. Smith FoundationU.S. ArmyU.S. Department of Health and Human ServicesMayo ClinicNational Institutes of HealthDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumAgency for Science, Technology and ResearchDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchFondation de FranceSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådCancer Council VictoriaCalifornia Department of Public HealthEuropean CommissionWorld Cancer Research FundStavros Niarchos FoundationCancer Council NSWSusan G. Komen for the Cure
Mots-clésPolygenic risk scoreBreast cancerMedicineOncologyDemographyCancerInternal medicineBiologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypeSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We evaluated the joint associations between a new 313-variant PRS (PRS313) and questionnaire-based breast cancer risk factors for women of European ancestry, using 72 284 cases and 80 354 controls from the Breast Cancer Association Consortium. Interactions were evaluated using standard logistic regression and a newly developed case-only method for breast cancer risk overall and by estrogen receptor status. After accounting for multiple testing, we did not find evidence that per-standard deviation PRS313 odds ratio differed across strata defined by individual risk factors. Goodness-of-fit tests did not reject the assumption of a multiplicative model between PRS313 and each risk factor. Variation in projected absolute lifetime risk of breast cancer associated with classical risk factors was greater for women with higher genetic risk (PRS313 and family history) and, on average, 17.5% higher in the highest vs lowest deciles of genetic risk. These findings have implications for risk prevention for women at increased risk of breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,826

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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