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Enregistrement W4400030840 · doi:10.1101/2024.06.25.600562

The PIN1-p38-CtIP signaling axis protects stalled replication forks from deleterious degradation

2024· preprint· en· W4400030840 sur OpenAlexaff
Francesca Vivalda, Marco Gatti, Letizia Manfredi, Hülya Doğan, Antônio Porro, Giulio Collotta, Ilaria Ceppi, Christine von Aesch, Vanessa van Ackeren, Sebastian Wild, Martin Steger, Begoña Cánovas, Monica Cubillos‐Rojas, Antoni Riéra, Petr Ćejka, Ángel R. Nebreda, Diego Dibitetto, Sven Rottenberg, Alessandro A. Sartori

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPIN1Replication (statistics)Cell biologyDegradation (telecommunications)BiologyVirologyComputer scienceGeneticsTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Human CtIP plays a critical role in homologous recombination (HR) by promoting the resection of DNA double-strand breaks. Moreover, CtIP maintains genome stability through protecting stalled replication forks from nucleolytic degradation. However, the upstream signaling mechanisms governing the molecular switch between these two CtIP-dependent processes remain largely elusive. Here, we show that phosphorylation of CtIP by the p38α stress kinase and subsequent PIN1-mediated CtIP cis -to- trans isomerization is required for fork stabilization but dispensable for HR. We found that stalled forks are degraded in cells expressing non-phosphorylatable CtIP or lacking PIN1-p38α activity, while expression of a CtIP trans -locked mutant overcomes the requirement for PIN1-p38α in fork protection. We further reveal that Brca1 -deficient mammary tumor cells that have acquired PARPi resistance regain chemosensitivity after PIN1 or p38α inhibition. Collectively, our findings identify the PIN1-p38-CtIP signaling pathway as a critical regulator of replication fork integrity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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