Role of cold shock proteins B and D in <i>Aeromonas salmonicida</i> subsp. <i>salmonicida</i> physiology and virulence in lumpfish ( <i>Cyclopterus lumpus</i> )
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Cold shock proteins (Csp) are pivotal nucleic acid binding proteins known for their crucial roles in the physiology and virulence of various bacterial pathogens affecting plant, insect, and mammalian hosts. However, their significance in bacterial pathogens of teleost fish remains unexplored. Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida (hereafter A. salmonicida ) is a psychrotrophic pathogen and the causative agent of furunculosis in marine and freshwater fish. Four csp genes ( cspB, cspD, cspA , and cspC ) have been identified in the genome of A. salmonicida J223 (wild type). Here, we evaluated the role of DNA binding proteins, CspB and CspD, in A. salmonicida physiology and virulence in lumpfish ( Cyclopterus lumpus ). A. salmonicida Δ cspB , Δ cspD , and the double Δ cspB Δ cspD mutants were constructed and characterized. A. salmonicida Δ cspB and Δ cspB Δ cspD mutants showed a faster growth at 28°C, and reduced virulence in lumpfish. A. salmonicida Δ cspD showed a slower growth at 28°C, biofilm formation, lower survival in low temperatures and freezing conditions (−20°C, 0°C, and 4°C), deficient in lipopolysaccharide synthesis, and low virulence in lumpfish. Additionally, Δ cspB Δ cspD mutants showed less survival in the presence of bile compared to the wild type. Transcriptome analysis revealed that 200, 37, and 921 genes were differentially expressed in Δ cspB , Δ cspD , and Δ cspB Δ cspD, respectively. In Δ cspB and Δ cspB Δ cspD virulence genes in the chromosome and virulence plasmid were downregulated. Our analysis indicates that CspB and CspD mostly act as a transcriptional activator, influencing cell division (e.g., treB ), virulence factors (e.g., aexT ), and ultimately virulence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».