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Enregistrement W4400208202 · doi:10.1038/s41588-024-01798-4

Understanding the genetic complexity of puberty timing across the allele frequency spectrum

2024· article· en· W4400208202 sur OpenAlexaff
Katherine A. Kentistou, Lena R Kaisinger, Stasa Stankovic, Marc Vaudel, Edson Mendes de Oliveira, Andrea Messina, Robin Walters, Xiaoxi Liu, Alexander S Busch, Hannes Helgason, Deborah J Thompson, Federico Santoni, Konstantin M. Petricek, Yassine Zouaghi, Isabel Huang-Doran, Daníel F. Guðbjartsson, Eirik Bratland, Kuang Lin, Eugene J. Gardner, Yajie Zhao, Raina Y Jia, Chikashi Terao, Marjorie J. Riggan, Manjeet K. Bolla, Mojgan Yazdanpanah, Nahid Yazdanpanah, Jonathan P Bradfield, Linda Broer, Archie Campbell, Daniel I. Chasman, Diana L. Cousminer, Nora Franceschini, Lude Franke, Giorgia Girotto, Chunyan He, Marjo‐Riitta Järvelin, Peter K. Joshi, Yoichiro Kamatani, Robert Karlsson, Jian’an Luan, Kathryn L. Lunetta, Reedik Mägi, Massimo Mangino, Sarah E. Medland, Christa Meisinger, Raymond Noordam, Teresa Nutile, Maria Pina Concas, Ozren Polašek, Eleonora Porcu, Susan M. Ring, Cinzia Sala, Albert V. Smith, Toshiko Tanaka, Peter J. van der Most, Véronique Vitart, Carol A. Wang, Gonneke Willemsen, Marek Zygmunt, Thomas U. Ahearn, Irene L. Andrulis, Hoda Anton-Culver, Antonis C Antoniou, Paul L. Auer, Catriona L. K. Barnes, Matthias W Beckmann, Amy Berrington de González, Natalia Bogdanova, Stig E. Bojesen, Hermann Brenner, Julie E. Buring, Federico Canzian, Jenny Chang‐Claude, Fergus J Couch, Angela Cox, Laura Crisponi, Kamila Czene, Mary B. Daly, Ellen W. Demerath, Joe Dennis, Peter Devilee, Immaculata De Vivo, Thilo Dörk, Alison M. Dunning, Miriam Dwek, Johan G. Eriksson, Peter A. Fasching, Lindsay Fernández‐Rhodes, Liana Ferreli, Olivia Fletcher, Manuela Gago-Domínguez, Montserrat García‐Closas, José Á. García-Sáenz, Anna González‐Neira, Harald Grallert, Pascal Guénel, Christopher A. Haiman, Per Hall, Ute Hamann, Håkon Håkonarson, Roger J Hart, Martha Hickey, Maartje J Hooning, Reiner Hoppe, John L Hopper, Jouke‐Jan Hottenga, Frank B Hu, Hanna Huebner, David J Hunter, Helena Jernström, Esther M John, David Karasik, Elza K. Khusnutdinova, Vessela N. Kristensen, James V. Lacey, Diether Lambrechts, Lenore J. Launer, Penelope A. Lind, Annika Lindblom, Patrik K. E. Magnusson, Mark I. McCarthy, Thomas Meitinger, Cristina Menni, Kyriaki Michailidou, Iona Y. Millwood, Roger L. Milne, Grant W. Montgomery, Heli Nevanlinna, Ilja M. Nolte, Dale R. Nyholt, Nadia Obi, Kenneth Offit, Albertine J. Oldehinkel, Sisse Rye Ostrowski, Aarno Palotie, Ole Birger Pedersen, Annette Peters, Giulia Pianigiani, Dijana Plaseska‐Karanfilska, Anneli Pouta, Alfred Pozarickij, Paolo Radice, Gad Rennert, Frits R. Rosendaal, Daniela Ruggiero, Emmanouil Saloustros, Dale P. Sandler, Sabine Schipf, Carsten Oliver Schmidt, Marjanka K. Schmidt, Kerrin S. Small, Beatrice Spedicati, Meir Stampfer, Jennifer Stone, Rulla M Tamimi, Lauren R. Teras, Emmi Tikkanen, Constance Turman, Celine M. Vachon, Qin Wang, Robert Winqvist, Alicja Wolk, Babette S. Zemel, Wei Zheng, Ko Willems van Dijk, Behrooz Z. Alizadeh, Stefania Bandinelli, Eric Boerwinkle, Dorret I. Boomsma, Marina Ciullo, Georgia Chenevix‐Trench, Francesco Cucca, Tõnu Esko, Christian Gieger, Struan F.A. Grant, Vilmundur Guðnason, Caroline Hayward, Ivana Kolčić, Peter Kraft, Debbie A. Lawlor, Nicholas G. Martin, Ellen A Nøhr, Nancy L Pedersen, Craig E. Pennell, Paul M Ridker, Antonietta Robino, Harold Snieder, Ulla Sovio, Tim D. Spector, Doris Stöckl, Cathie Sudlow, Nicholas J. Timpson, Daniela Toniolo, André G. Uitterlinden, Sheila Ulivi, Henry Völzke, Nicholas J. Wareham, Elisabeth Widen, James F. Wilson, Paul D.P. Pharoah, Liming Li, Douglas F. Easton, Pål R. Njølstad, Patrick Sulem, Joanne M. Murabito, Anna Murray, Despoina Manousaki, Anders Juul, Christian Erikstrup, Kāri Stefánsson, Momoko Horikoshi, Zhengming Chen, I. Sadaf Farooqi, Nelly Pitteloud, Stefan Johansson, Felix R. Day, John R. B. Perry, Ken K. Ong

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineCentre for Global Health ResearchUniversity of TorontoMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMedical Research FoundationMedical Research CouncilResearch Councils UKNovo Nordisk FondenNational Institute of Environmental Health Sciences
Mots-clésBiologyAlleleAllele frequencyGeneticsEvolutionary biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pubertal timing varies considerably and is associated with later health outcomes. We performed multi-ancestry genetic analyses on ~800,000 women, identifying 1,080 signals for age at menarche. Collectively, these explained 11% of trait variance in an independent sample. Women at the top and bottom 1% of polygenic risk exhibited ~11 and ~14-fold higher risks of delayed and precocious puberty, respectively. We identified several genes harboring rare loss-of-function variants in ~200,000 women, including variants in ZNF483, which abolished the impact of polygenic risk. Variant-to-gene mapping approaches and mouse gonadotropin-releasing hormone neuron RNA sequencing implicated 665 genes, including an uncharacterized G-protein-coupled receptor, GPR83, which amplified the signaling of MC3R, a key nutritional sensor. Shared signals with menopause timing at genes involved in DNA damage response suggest that the ovarian reserve might signal centrally to trigger puberty. We also highlight body size-dependent and independent mechanisms that potentially link reproductive timing to later life disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,300
Score d'incertitude au seuil0,345

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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