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Enregistrement W4400357265 · doi:10.1016/j.cell.2024.06.011

Early rhombic lip Protogenin+ve stem cells in a human-specific neurovascular niche initiate and maintain group 3 medulloblastoma

2024· article· en· W4400357265 sur OpenAlexafffund
Abhirami Visvanathan, Olivier Saulnier, Chuan Chen, Parthiv Haldipur, Wilda Orisme, Alberto Delaidelli, Seungmin Shin, Jake Millman, Andrew J. Bryant, Namal Abeysundara, Xujia Wu, Liam D. Hendrikse, Vikas Patil, Zahedeh Bashardanesh, Joseph Golser, Bryn G. Livingston, Takuma Nakashima, Yusuke Funakoshi, Winnie Ong, Alexandra Rasnitsyn, Kimberly A. Aldinger, Cory M. Richman, Randy Van Ommeren, John J.Y. Lee, Michelle Ly, Maria Vladoiu, Kaitlin Kharas, Polina Balin, Anders W. Erickson, Vernon Fong, Jiao Zhang, Raúl A. Suárez, Hao Wang, Ning Huang, Jonelle G. Pallota, Tajana Douglas, Joonas Haapasalo, Férechté Razavi, Evelina Silvestri, Olga Sirbu, Samantha Worme, Michelle M. Kameda-Smith, Xiaochong Wu, Craig Daniels, Antony MichaelRaj, Aparna Bhaduri, Daniel Schramek, Hiromichi Suzuki, Livia Garzia, Nabil Ahmed, Claudia L. Kleinman, Lincoln Stein, Peter Dirks, Christopher Dunham, Nada Jabado, Jeremy N. Rich, Wei Li, Poul H. Sorensen, Robert J. Wechsler‐Reya, William A. Weiss, Kathleen J. Millen, David W. Ellison, Dimiter S. Dimitrov, Michael D. Taylor

Notice bibliographique

RevueCell · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensBC Children's HospitalOntario Institute for Cancer ResearchJewish General HospitalMcGill UniversityMcGill University Health CentreSinai Health SystemPrincess Margaret Cancer CentreLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteBC Cancer AgencySickKids FoundationUniversity Health NetworkUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthBrain Tumour CharityCanadian Cancer SocietyCancer Research UKEntertainment Industry FoundationStand Up To CancerHospital for Sick ChildrenGenome British ColumbiaGovernment of CanadaSwifty FoundationOntario Institute for Cancer ResearchGenome CanadaGovernment of OntarioNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of PittsburghOntario Research FoundationCanadian Cancer Society Research InstituteMatthew Larson Foundation for Pediatric Brain TumorsUniversity of TorontoV Foundation for Cancer ResearchCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Research InstituteCancer Prevention and Research Institute of TexasPediatric Brain Tumor FoundationAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésBiologyMedulloblastomaNeurovascular bundleNicheStem cellCell biologyAnatomyGeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We identify a population of Protogenin-positive (PRTG +ve ) MYC high NESTIN low stem cells in the four-week-old human embryonic hindbrain that subsequently localizes to the ventricular zone of the rhombic lip (RL VZ ). Oncogenic transformation of early Prtg +ve rhombic lip stem cells initiates group 3 medulloblastoma (Gr3-MB)-like tumors. PRTG +ve stem cells grow adjacent to a human-specific interposed vascular plexus in the RL VZ , a phenotype that is recapitulated in Gr3-MB but not in other types of medulloblastoma. Co-culture of Gr3-MB with endothelial cells promotes tumor stem cell growth, with the endothelial cells adopting an immature phenotype. Targeting the PRTG high compartment of Gr3-MB in vivo using either the diphtheria toxin system or chimeric antigen receptor T cells constitutes effective therapy. Human Gr3-MBs likely arise from early embryonic RL VZ PRTG +ve stem cells inhabiting a specific perivascular niche. Targeting the PRTG high compartment and/or the perivascular niche represents an approach to treat children with Gr3-MB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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