Temporal Evaluation of a Minimally Invasive Method of Preimplantation Genetic Testing for Aneuploidy (mi-PGT-A) in Human Embryos
Notice bibliographique
Résumé
Preimplantation genetic testing for aneuploidy (PGT-A) has become a useful approach for embryo selection following IVF and ICSI. However, the biopsy process associated with PGT-A is expensive, prone to errors in embryo ploidy determination, and potentially damaging, impacting competence and implantation potential. Therefore, a less invasive method of PGT-A would be desirable and more cost-effective. Noninvasive methods for PGT-A (ni-PGT-A) have been well-studied but present limitations in terms of cf-DNA origin and diagnostic accuracy. Minimally invasive pre-implantation genetic testing (mi-PGT-A) for frozen-thawed embryo transfer is a promising, less studied approach that utilizes a combination of spent culture media (SCM) and blastocoelic fluid (BF)-derived cell-free (CF)-DNA for genetic testing. This study aimed to optimize the effectiveness of mi-PGT-A for aneuploidy diagnosis by investigating the optimal temporal sequence for this protocol. SCM+BF was collected at either 48 or 72 h of culture after thawing day 3 preimplantation embryos. cf-DNA in the SCM+BF was amplified, analyzed by next-generation sequencing (NGS) and compared with results from the corresponding whole embryos (WEs) obtained from human embryos donated for research. Fifty-three (42 expanded blastocysts, 9 early blastocysts, and 2 morula) WE and SCM+BF samples were analyzed and compared. The overall concordance rate between SCM+BF and WE was 60%. Gender and ploidy concordance improved with extended culture time from 48 h (73% and 45%) to 72 h (100% and 64%), respectively. These results demonstrate that SCM+BF-derived cf-DNA can be successfully used for mi-PGT-A. Our findings indicate that longer embryo culture time prior to SCM+BF-derived cf-DNA analysis improves DNA detection rate and concordance with WEs and decreases the proportion of false positive results.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».