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Enregistrement W4400505429 · doi:10.1080/09670262.2024.2353940

<i>Plocamiomonas psychrophila</i> gen. et sp. nov. (Pelagophyceae, Heterokontophyta), an Arctic marine nanoflagellate characterized by microscopy, pigments and molecular phylogeny

2024· article· en· W4400505429 sur OpenAlexafffund
Niels Daugbjerg, Cecilie Lara, Frederik Frøsig Gai, Connie Lovejoy

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Phycology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHartmann FondenCarlsbergfondetUniversité Laval
Mots-clésBiologyArcticBayPhylogeneticsFlagellumPhylogenetic treeUltrastructureMolecular phylogeneticsBotanyZoologyEcologyPaleontologyOceanographyGeneBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During a field campaign in Baffin Bay (June, 1998), a sample dominated by small yellow brown biflagellates was collected from a small pocket of liquid water on the sea ice and established into a unialgal culture. Later it was given strain number CCMP2097 and deposited at the NCMA collection. Growth experiments over a range of temperatures and salinities indicated adaptation to variable Arctic conditions. This strain was studied here using light and transmission electron microscopy, HPLC for characterization of photosynthetic pigments and the relationship to related taxa was elucidated from molecular phylogeny. This integrative approach resulted in suggesting Plocamiomonas psychrophila gen. et sp. nov. the first systematically named Arctic species of the Pelagophyceae. Plocamiomonas had two unequally long flagella and the spherical cells measured 7.5 µm in diameter. Novel morphological characters included (1) a swelling on the mature flagellum, (2) a bi-layered theca, thin elongated arm-like structures emanating from the cell surface and (3) a thin filament above the flagellar transition region. This set of morphological characters represented a novel combination for the Pelagophyceae and together with evidence from the phylogenetic position of Plocamiomonas and eight uncultured cold-water pelagophytes supported the proposal of a new order Plocamiomonadales and a new family Plocamiomonadaceae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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