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Enregistrement W4400601841 · doi:10.1016/j.celrep.2024.114479

Multiple transatlantic incursions of highly pathogenic avian influenza clade 2.3.4.4b A(H5N5) virus into North America and spillover to mammals

2024· article· en· W4400601841 sur OpenAlexafffundabout
Cassidy N. G. Erdelyan, Ahmed Kandeil, Anthony V. Signore, Megan Jones, Peter Vogel, Konstantin Andreev, Cathrine Arnason Bøe, Britt Gjerset, Tamiru N. Alkie, Carmencita Yason, Tamiko Hisanaga, Daniel M. Sullivan, Oliver Lung, Laura Bourque, Ifeoluwa Ayilara, Lemarie Pama, Trushar Jeevan, John Franks, Jeremy C. Jones, Jon P. Seiler, Lance A. Miller, Samira Mubareka, Richard J. Webby, Yohannes Berhane

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreUniversity of ManitobaUniversity of Prince Edward IslandCanadian Science Centre for Human and Animal Health
Organismes subventionnairesDepartment of Energy, Environment and Climate ActionNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Wildlife Health CooperativeCanadian Institutes of Health ResearchEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of TorontoDefence Research and Development CanadaParks CanadaNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésInfluenza A virus subtype H5N1BiologyCladeHighly pathogenicVirologyTransmission (telecommunications)NeuraminidaseVirusViral evolutionVirulenceH5N1 genetic structureInfluenza A virusZoologyOseltamivirPhylogeneticsGeneInfectious disease (medical specialty)GenomeDiseaseGeneticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Highly pathogenic avian influenza (HPAI) viruses have spread at an unprecedented scale, leading to mass mortalities in birds and mammals. In 2023, a transatlantic incursion of HPAI A(H5N5) viruses into North America was detected, followed shortly thereafter by a mammalian detection. As these A(H5N5) viruses were similar to contemporary viruses described in Eurasia, the transatlantic spread of A(H5N5) viruses was most likely facilitated by pelagic seabirds. Some of the Canadian A(H5N5) viruses from birds and mammals possessed the PB2-E627K substitution known to facilitate adaptation to mammals. Ferrets inoculated with A(H5N5) viruses showed rapid, severe disease onset, with some evidence of direct contact transmission. However, these viruses have maintained receptor binding traits of avian influenza viruses and were susceptible to oseltamivir and zanamivir. Understanding the factors influencing the virulence and transmission of A(H5N5) in migratory birds and mammals is critical to minimize impacts on wildlife and public health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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