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Enregistrement W4400621681 · doi:10.1111/imm.13836

Polygenic <scp>TB</scp> control and the sequence of innate/adaptive immune responses to infection: <scp>MHC</scp>‐<scp>II</scp> alleles determine the size of the <scp>S100A8</scp>/9‐producing neutrophil population

2024· article· en· W4400621681 sur OpenAlexfundno aff
Н. Н. Логунова, Marina A. Kapina, Alexander Dyatlov, Tatiana Kondratieva, Elvira I. Rubakova, Konstantin B. Majorov, Elena Kondratieva, Irina Linge, Alexander Apt

Notice bibliographique

RevueImmunology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRussian Science FoundationMcGill University
Mots-clésBiologyMajor histocompatibility complexCongenicPhenotypePopulationImmunologyImmune systemAcquired immune systemAlleleS100A8GeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Among several quantitative trait loci involved in tuberculosis (TB) control in mice, one was mapped within the chromosome 17 segment occupied by the H2 complex and another within the chromosome 3 segment comprising the S100A8/9 genes, which encode neutrophil inflammatory factor S100A8/9. Previously, we developed a panel of H2 ‐congenic mouse strains differing by small segments of the major histocompatibility complex Class II (MHC‐II) region from TB‐susceptible H2 j mice transferred onto the genetic background of the TB‐resistant C57BL/6 ( H2 b ) strain. Susceptible B6.I‐9.3 mice differ from B6 progenitors by the alleles of their only classical MHC‐II H2‐Aβ gene. The goals of the present study were to: (i) comprehensively characterise the differences in TB‐related phenotypes between mice of the two strains and (ii) decipher interactions between the H2‐Aβ and S100A8/9 genes. Here, we describe the dynamics of TB‐related phenotypes differentiating B6.I‐9.3 and B6 mice (colony forming units counts, histopathology, lung immune cell infiltration and cytokine profiles). We show that disproportionally diminished CD4 + T‐cell population, an enlarged S100A8/9‐positive neutrophil population and higher S100A8/9 serum levels in B6.I‐9.3 mice collectively form the ‘susceptible’ phenotype before infection. An increase in IL‐17 and a decrease in intrferon‐gamma production by CD4 + T‐cells in these mice provide a mechanistic explanation of this phenotype. Using F2 segregation analysis, we show that the number of S100A8/9‐producing neutrophils in lungs and spleens and the proportion of Th17 CD4 + T‐cells in lungs are significantly lower in the presence of the MHC‐II dominant ‘resistant’ b allele compared to the recessive ‘susceptible’ j/j genotype. This provides direct genetic evidence that MHC‐II‐regulated CD4 + T‐cell landscapes determine neutrophil abundance before infection, an important pathogenic factor in TB immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,436
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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