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Enregistrement W4400649273 · doi:10.1109/imbioc60287.2024.10590498

Developing Magnetic Resonance Reporter Gene Imaging: Essential Magnetosome Proteins Interact in Mammalian Cells

2024· article· en· W4400649273 sur OpenAlexaff
Qin Sun, Fateh Ahmad, Cécile Fradin, Terry Thompson, Frank S. Prato, Donna E. Goldhawk

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueNuclear Physics and Applications
Établissements canadiensMcMaster UniversityLawson Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMagnetosomeMagnetotactic bacteriaMagnetic resonance imagingMolecular biophysicsCell biologyNuclear magnetic resonanceBiologyBacteriaPhysicsGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To detect cellular activities deep within the body using magnetic resonance (MR) platforms, magnetosomes are the ideal model of genetically-encoded nanoparticles. These organelle-like structures produced by magnetotactic bacteria (MTB) store iron biominerals in membrane-bound vesicles and are highly regulated by approximately 30 genes. To translate this technology into a gene-based iron contrast agent in mammalian cells [1], [2], we are introducing essential membrane-associated magnetosome (mam) genes mamI, mamL, mamB, and mamE into the human melanoma cell line MDA-MB-435 using fluorescent fusion protein vectors. While the expression of enhanced green fluorescent protein (EGFP)-MamI alone resulted in a net-like fluorescence pattern, individual expression of red fluorescent Tomato-MamL, Tomato-MamB, or Tomato-MamE all resulted in a mobile, punctate fluorescence pattern. Coexpression of MamL+I resulted in co-localization of both proteins in a mobile, punctate pattern. Here we report the transient expression of three magnetosome proteins (MamL+I+B or MamL+I+E) in mammalian cells, which results in the co-localization and interaction of all three proteins in a mobile, punctate pattern. These results further support interactions between essential magnetosome proteins in the mammalian intracellular compartment and the co-localization required to form a rudimentary magnetosome-like particle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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