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Enregistrement W4400724898 · doi:10.11110/kjpt.2024.54.2.121

The complete chloroplast genome sequence of Viola labradorica (Violaceae)

2024· article· en· W4400724898 sur OpenAlexaboutno aff
Ah-reum Go, Ki‐Oug Yoo

Notice bibliographique

RevueKorean Journal of Plant Taxonomy · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Science and ICT, South KoreaNational Research Foundation of KoreaNational Research Foundation
Mots-clésViolaceaeBiologyPhylogenetic treeViolaCladeChloroplast DNAMonophylyGenomeGenusBotanyEvolutionary biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Viola labradorica is commonly known as Alpine violet, American dog violet, Dog violet, and Labrador violet. This species is distributed throughout eastern Canada and North America. In the present study, we sequenced the chloroplast genome of V. labradorica for the first time and performed a phylogenetic analysis of the genus Viola. The length of the chloroplast genome of V. labradorica was 158,751 bp. A large single-copy region (87,211 bp), a small single-copy region (17,344 bp), and two inverted repeat regions (27,098 bp each) were identified. A phylogenetic analysis was conducted using 77 protein-coding genes from the chloroplast genomes of 34 Viola. Salix koriyanagi (Salicaceae) was used as an outgroup. The genus Viola forms a monophyletic clade. Among the clades for the genus Viola, the sect. Viola formed a clade and was divided into two subclades: subsect. Viola and subsect. Rostratae. Within the subsect. Rostratae, V. labradorica was placed in a basal position. These results contribute to a clear identification of the phylogenetic position of V. labradorica in the subsect. Rostratae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,801
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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