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Enregistrement W4400777194 · doi:10.1021/acs.jmedchem.4c00629

Discovery of Two Highly Selective Structurally Orthogonal Chemical Probes for Activin Receptor-like Kinases 1 and 2

2024· article· en· W4400777194 sur OpenAlexaff
Václav Němec, Marek Remeš, Petr Beňovský, M. Böck, Eliška Šranková, Jong Fu Wong, Julien Cros, Eleanor Williams, Lap Hang Tse, David Smil, Deeba Ensan, Methvin Isaac, Rima Al‐awar, Regina Gomolková, Vlad-Constantin Ursachi, Bohumil Fafílek, Zuzana Kahounová, Ráchel Víchová, Ondřej Vacek, Benedict‐Tilman Berger, Carrow I. Wells, Cesear Corona, James D. Vasta, Matthew B. Robers, Pavel Krejčı́, Karel Souček, Alex N. Bullock, Stefan Knapp, Kamil Paruch

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHeterotopic Ossification and Related Conditions
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesMasarykova UniverzitaAgentura Pro Zdravotnický Výzkum České RepublikyGrantová Agentura České RepublikyMinisterstvo Školství, Mládeže a TělovýchovyEuropean CommissionBader Philanthropies
Mots-clésChemistrySMADKinaseBone morphogenetic proteinBMPR2Signal transductionActivin receptorProtein-Serine-Threonine KinasesCell biologyReceptorACVR2BBone morphogenetic protein 2BiochemistryProtein kinase ATGF beta signaling pathwayBiologyGeneIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Activin receptor-like kinases 1–7 (ALK1–7) regulate a complex network of SMAD-independent as well as SMAD-dependent signaling pathways. One of the widely used inhibitors for functional investigations of these processes, in particular for bone morphogenetic protein (BMP) signaling, is LDN-193189 . However, LDN-193189 has insufficient kinome-wide selectivity complicating its use in cellular target validation assays. Herein, we report the identification and comprehensive characterization of two chemically distinct highly selective inhibitors of ALK1 and ALK2, M4K2234 and MU1700, along with their negative controls. We show that both MU1700 and M4K2234 efficiently block the BMP pathway via selective in cellulo inhibition of ALK1/2 kinases and exhibit favorable in vivo profiles in mice. MU1700 is highly brain penetrant and shows remarkably high accumulation in the brain. These high-quality orthogonal chemical probes offer the selectivity required to become widely used tools for in vitro and in vivo investigation of BMP signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,313

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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