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Enregistrement W4400964177 · doi:10.1101/2024.07.22.604381

Early morphogenetic patterns of protonemata and gametophores of <i>Physcomitrium patens</i> (Hedw.) Mitt

2024· preprint· en· W4400964177 sur OpenAlexaff
M. V. S. Raju, Neil W. Ashton

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtonemaElongationOblique caseApex (geometry)Tip growthPhysicsGeometryOpticsChemistryCrystallographyMaterials scienceAnatomyBiologyBotanyMossComposite materialMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In axenic culture, protonemata of Physcomitrium (formerly Physcomitrella ) patens (Hedw.) Mitt. are comprised of chloronemata and caulonemata that can be distinguished morpho-structurally. On solid nutrient agar medium, a protonemal inoculum proliferates, initially generating primary chloronemata, and expands radially across the surface of the substratum forming approximately round colonies. The expansion of the colonies derives mainly from centrifugal elongation of newly formed caulonemata, which arise by differentiation of primary chloronemal apical cells in the central region. Most commonly, oblique cross walls separate cells of the uniseriate caulonemal filaments. Each oblique wall organises a smaller and a larger angle with the outer wall of a tubular caulonemal cell. The smaller angle may lie in four different positions, vertically upward or downward, and laterally, to the right or left, parallel to the surface of the solid medium. Chloronemal filaments, which contain cells separated by transverse cross walls, develop from side branch initials (SBIs) at or near the smaller angle at the distal end of caulonemal cells. Like the smaller angle of the oblique cross walls in caulonemata, these secondary chloronemata also show four different orientations, vertically, upward or downward, and laterally, right or left. A strong inverse correlation exists between the placement of SBIs and secondary chloronemata and the direction of caulonemal tip growth. If the caulonemal tips curve downward into the medium, chloronemata are situated vertically on the upper side of caulonemata; similarly, if they turn upward, chloronemata are situated on the lower side. A similar correlation exists when caulonemal tips curve to the right or left on the surface of solid medium, in which case laterally directed chloronemata grow in the opposite direction, i.e. on the outside of the curve. The procumbent caulonemata with their associated protruding secondary chloronemal branches are reminiscent of the heterotrichous branching habit of filaments of some green algae. Gametophore buds develop from a minority of caulonemal SBIs and also occasionally from chloronemata; a stalk cell, which resembles a chloronemal cell, supports each bud. Buds develop into leafy gametophores that are arranged in a fairy ring. We discuss the relative merits of several models that might explain the temporally and spatially regulated clustering of buds resulting in the formation of a fairy ring.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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