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Enregistrement W4401015780 · doi:10.1016/j.heliyon.2024.e35276

Biophysical profiling of red blood cells from thin-film blood smears using deep learning

2024· article· en· W4401015780 sur OpenAlex
Erik S. Lamoureux, You Cheng, Emel Islamzada, Kerryn Matthews, Simon P. Duffy, Hongshen Ma

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueHeliyon · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueDigital Imaging for Blood Diseases
Établissements canadiensVancouver General HospitalBritish Columbia Institute of TechnologyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaCanadian Blood ServicesAustralian Government
Mots-clésRed blood cellBlood smearConvolutional neural networkPathologyBiomedical engineeringDeep learningBlood cellMedicineArtificial intelligenceComputer scienceImmunologyMalaria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microscopic inspection of thin-film blood smears is widely used to identify red blood cell (RBC) pathologies, including malaria parasitism and hemoglobinopathies, such as sickle cell disease and thalassemia. Emerging research indicates that non-pathologic changes in RBCs can also be detected in images, such as deformability and morphological changes resulting from the storage lesion. In transfusion medicine, cell deformability is a potential biomarker for the quality of donated RBCs. However, a major impediment to the clinical translation of this biomarker is the difficulty associated with performing this measurement. To address this challenge, we developed an approach for biophysical profiling of RBCs based on cell images in thin-film blood smears. We hypothesize that subtle cellular changes are evident in blood smear images, but this information is inaccessible to human expert labellers. To test this hypothesis, we developed a deep learning strategy to analyze Giemsa-stained blood smears to assess the subtle morphologies indicative of RBC deformability and storage-based degradation. Specifically, we prepared thin-film blood smears from 27 RBC samples (9 donors evaluated at 3 storage time points) and imaged them using high-resolution microscopy. Using this dataset, we trained a convolutional neural network to evaluate image-based morphological features related to cell deformability. The prediction of donor deformability is strongly correlated to the microfluidic scores and can be used to categorize images into specific deformability groups with high accuracy. We also used this model to evaluate differences in RBC morphology resulting from cold storage. Together, our results demonstrate that deep learning models can detect subtle cellular morphology differences resulting from deformability and cold storage. This result suggests the potential to assess donor blood quality from thin-film blood smears, which can be acquired ubiquitously in clinical workflows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,265
Score d'incertitude au seuil0,831

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle