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Enregistrement W4401173915 · doi:10.1016/j.molcel.2024.07.003

The V-ATPase/ATG16L1 axis is controlled by the V1H subunit

2024· article· en· W4401173915 sur OpenAlexaff
Lewis Timimi, Antoni G. Wrobel, George N. Chiduza, Sarah Maslen, Antonio Torres-Méndez, Beatriz Montaner, Colin Davis, Taylor F. Minckley, Katriona L. Hole, Andrea Serio, Michael J. Devine, Mark Skehel, John L. Rubinstein, Anne Schreiber, Rupert Beale

Notice bibliographique

RevueMolecular Cell · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFrancis Crick InstituteCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésBiologyCell biologyAutophagyOrganelleATG16L1UbiquitinProtein subunitATG8ATPaseMembraneBiophysicsBiochemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Defects in organellar acidification indicate compromised or infected compartments. Recruitment of the autophagy-related ATG16L1 complex to pathologically neutralized organelles targets ubiquitin-like ATG8 molecules to perturbed membranes. How this process is coupled to proton gradient disruption is unclear. Here, we reveal that the V 1 H subunit of the vacuolar ATPase (V-ATPase) proton pump binds directly to ATG16L1. The V 1 H/ATG16L1 interaction only occurs within fully assembled V-ATPases, allowing ATG16L1 recruitment to be coupled to increased V-ATPase assembly following organelle neutralization. Cells lacking V 1 H fail to target ATG8s during influenza infection or after activation of the immune receptor stimulator of interferon genes (STING). We identify a loop within V 1 H that mediates ATG16L1 binding. A neuronal V 1 H isoform lacks this loop and is associated with attenuated ATG8 targeting in response to ionophores in primary murine and human iPSC-derived neurons. Thus, V 1 H controls ATG16L1 recruitment following proton gradient dissipation, suggesting that the V-ATPase acts as a cell-intrinsic damage sensor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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