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Enregistrement W4401173915 · doi:10.1016/j.molcel.2024.07.003

The V-ATPase/ATG16L1 axis is controlled by the V1H subunit

2024· article· en· W4401173915 sur OpenAlexaff
Lewis Timimi, Antoni G. Wrobel, George N. Chiduza, Sarah Maslen, Antonio Torres-Méndez, Beatriz Montaner, Colin Davis, Taylor F. Minckley, Katriona L. Hole, Andrea Serio, Michael J. Devine, Mark Skehel, John L. Rubinstein, Anne Schreiber, Rupert Beale

Notice bibliographique

RevueMolecular Cell · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFrancis Crick InstituteCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésBiologyCell biologyAutophagyOrganelleATG16L1UbiquitinProtein subunitATG8ATPaseMembraneBiophysicsBiochemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Defects in organellar acidification indicate compromised or infected compartments. Recruitment of the autophagy-related ATG16L1 complex to pathologically neutralized organelles targets ubiquitin-like ATG8 molecules to perturbed membranes. How this process is coupled to proton gradient disruption is unclear. Here, we reveal that the V 1 H subunit of the vacuolar ATPase (V-ATPase) proton pump binds directly to ATG16L1. The V 1 H/ATG16L1 interaction only occurs within fully assembled V-ATPases, allowing ATG16L1 recruitment to be coupled to increased V-ATPase assembly following organelle neutralization. Cells lacking V 1 H fail to target ATG8s during influenza infection or after activation of the immune receptor stimulator of interferon genes (STING). We identify a loop within V 1 H that mediates ATG16L1 binding. A neuronal V 1 H isoform lacks this loop and is associated with attenuated ATG8 targeting in response to ionophores in primary murine and human iPSC-derived neurons. Thus, V 1 H controls ATG16L1 recruitment following proton gradient dissipation, suggesting that the V-ATPase acts as a cell-intrinsic damage sensor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,376
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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