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Enregistrement W4401181399 · doi:10.1101/2024.07.30.605496

Bacteria combine polar- and dispersed-growth to power cell elongation and wall width dynamics

2024· preprint· en· W4401181399 sur OpenAlexaff
Matthew Zambri, Christine R Baglio, Oihane Irazoki, Stephanie E. Jones, Ethan C. Garner, Felipe Cava, Marie A. Elliot

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMreBPeptidoglycanBacteriaCell wallBacterial cell structureFtsZBacterial growthCell divisionCell growthActinobacteriaBiologyCell biologyStreptomycesChemistryBiophysicsMicrobiologyCellCytoskeletonBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The cell wall is a complex structure. For most bacteria, peptidoglycan is an essential component of their cell wall, with different bacteria having evolved distinct biosynthetic strategies. The mechanisms driving bacterial growth can be divided into three, mutually-exclusive categories: (i) dispersed growth, mediated by MreB and employed by many rod-shaped bacteria; (ii) polar growth, driven by distinct proteins in the actinobacteria and rhizobiales; and (iii) septal growth, fueled by FtsZ in many coccoid bacteria. Here, we show that under conditions of rapid growth, the actinobacterial representative Streptomyces venezuelae transcends these categories, simultaneously employing both canonical polar growth, and MreB-mediated dispersed growth. Our results indicate that MreB is essential for cell wall integrity and culture viability under these growth conditions, promotes dynamic cell wall changes over the course of a growth cycle, and contributes to a wall that is structurally distinct from that of conventionally growing streptomycetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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