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Enregistrement W4401208974 · doi:10.1101/2024.07.30.604739

Preparation of inexpensive, pre-stained molecular weight marker using proteins isolated from chicken egg for SDS PAGE and Western blot application

2024· preprint· en· W4401208974 sur OpenAlexaff
Karthika KB Balaji, Vini VJ Jain, Sundarraj SR Rangasamy, Gokila GR Rajendran, Vinothkumar VK Kittappa, Arumugam Muruganandam

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal health and immunology
Établissements canadiensEmergent BioSolutions (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular massWestern blotYolkBlotSize-exclusion chromatographyRecombinant DNAMolecular markerBiologyEgg whiteMolecular biologyBiochemistryEscherichia coliGeneChemistryFood scienceEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Molecular weight markers, which are utilized in protein chemistry applications, including gel filtration chromatography, SDS-PAGE, and Western blotting, determine the molecular weight of distinct proteins that have been separated. These markers act as standards and are made of a variety of differently sized proteins that lie within a wide range of sizes corresponding to known molecular weights. They are indispensable tools in techniques such as protein analysis and characterization, as they may be used to estimate the approximate molecular weight of unknown proteins by comparing their movement pattern on the gel to established standards. Molecular weight markers can be obtained from multiple sources. There are many ways to obtain molecular weight markers, such as recombinant expression from organisms such as E. coli or mammalian cells as well as purification of proteins from organisms such as E. coli , bovine plasma, porcine muscle, and bovine milk. Moreover, the chicken egg white and egg yolk consist of proteins of varying molecular weights. This study aims to employ cost effective natural products such as chicken egg to create easily developed, reasonably priced protein markers with molecular weights that range from 250 to 14 kDa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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