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Enregistrement W4401337535 · doi:10.1111/febs.17243

Oxidative stress‐induced <i>YAP1</i> expression is regulated by <i>NCE102</i>, <i>CDA2</i>, and <i>BCS1</i>

2024· article· en· W4401337535 sur OpenAlexafffund
Sarah Takallou, Maryam Hajikarimlou, Mustafa Al‐gafari, Jiashu Wang, Sasi Kumar Jagadeesan, Thomas David Daniel Kazmirchuk, Christina Arnoczki, Houman Moteshareie, Kamaleldin B. Said, Taha Azad, Martin Holčı́k, Bahram Samanfar, Myron L. Smith, Ashkan Golshani

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaCarleton UniversityCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de SherbrookeHealth CanadaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésYAP1Oxidative stressReactive oxygen speciesOxidative phosphorylationCell biologyTranslation (biology)BiologyBiochemistryTranscription factorChemistryGeneMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maintaining cellular homeostasis in the face of stress conditions is vital for the overall well‐being of an organism. Reactive oxygen species (ROS) are among the most potent cellular stressors and can disrupt the internal redox balance, giving rise to oxidative stress. Elevated levels of ROS can severely affect biomolecules and have been associated with a range of pathophysiological conditions. In response to oxidative stress, yeast activator protein‐1 (Yap1p) undergoes post‐translation modification that results in its nuclear accumulation. YAP1 has a key role in oxidative detoxification by promoting transcription of numerous antioxidant genes. In this study, we identified previously undescribed functions for NCE102 , CDA2 , and BCS1 in YAP1 expression in response to oxidative stress induced by hydrogen peroxide (H 2 O 2 ). Deletion mutant strains for these candidates demonstrated increased sensitivity to H 2 O 2 . Our follow‐up investigation linked the activity of these genes to YAP1 expression at the level of translation. Under oxidative stress, global cap‐dependent translation is inhibited, prompting stress‐responsive genes like YAP1 to employ alternative modes of translation. We provide evidence that NCE102 , CDA2 , and BCS1 contribute to cap‐independent translation of YAP1 under oxidative stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,856

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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