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Enregistrement W4401441587 · doi:10.1126/sciadv.adp6182

Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals mitochondrial calcium signaling as a modulator of endothelial-to-mesenchymal transition

2024· article· en· W4401441587 sur OpenAlexaff
Mathilde Lebas, Giorgia Chinigò, Evan Courmont, Louay Bettaieb, Amani Machmouchi, Jermaine Goveia, Aleksandar Beatovic, Job Van Kerckhove, Cyril Robil, Mauro Vedelago, Alina Errerd, Lucas Treps, Vance Gao, Hilda Carolina Delgado-De la Herrán, Alicia Mayeuf-Louchart, Laurent L’homme, Mohamed Chamlali, Camille Dejos, Valérie Gouyer, Venkata Naga Srikanth Garikipati, Dhanendra Tomar, Hao Yin, Hajime Fukui, Stefan Vinckier, Anneke Stolte, Lena‐Christin Conradi, Fabrice Infanti, Loïc Lemonnier, Elisabeth M. Zeisberg, Yonglun Luo, Lin Lin, Jean‐Luc Desseyn, J. Geoffrey Pickering, Raj Kishore, Muniswamy Madesh, David Dombrowicz, Fabiana Perocchi, Bart Staels, Alessandra Fiorio, Dimitra Gkika, Anna Rita Cantelmo

Notice bibliographique

RevueScience Advances · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesSteno Diabetes Center AarhusNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteRégion Hauts-de-FranceNovo Nordisk FondenAgence Nationale de la RechercheLigue Contre le CancerKU LeuvenUniversité de Lille
Mots-clésMesenchymal stem cellCell biologyCalciumCalcium signalingRNA-SeqCellRNAChemistryBiologySignal transductionBiochemistryGene expressionGeneTranscriptome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endothelial cells (ECs) are highly plastic, capable of differentiating into various cell types. Endothelial-to-mesenchymal transition (EndMT) is crucial during embryonic development and contributes substantially to vascular dysfunction in many cardiovascular diseases (CVDs). While targeting EndMT holds therapeutic promise, understanding its mechanisms and modulating its pathways remain challenging. Using single-cell RNA sequencing on three in vitro EndMT models, we identified conserved gene signatures. We validated original regulators in vitro and in vivo during embryonic heart development and peripheral artery disease. EndMT induction led to global expression changes in all EC subtypes rather than in mesenchymal clusters. We identified mitochondrial calcium uptake as a key driver of EndMT; inhibiting mitochondrial calcium uniporter (MCU) prevented EndMT in vitro, and conditional Mcu deletion in ECs blocked mesenchymal activation in a hind limb ischemia model. Tissues from patients with critical limb ischemia with EndMT features exhibited significantly elevated endothelial MCU. These findings highlight MCU as a regulator of EndMT and a potential therapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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