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Enregistrement W4401496155 · doi:10.5376/mpb.2024.15.0013

From Ancestors to Modern Cultivars: Tracing the Origin, Evolution, and Genetic Progress in Cucurbitaceae

2024· article· en· W4401496155 sur OpenAlexvenueno aff
Xuehao Chen, Xiaohua Qi, Xuewen Xu

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvances in Cucurbitaceae Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGovernment of Jiangsu ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésCucurbitaceaeBiologyCultivarEvolutionary biologyDomesticationBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Cucurbitaceae family, encompassing a wide array of economically significant species, has undergone extensive evolutionary diversification since its origin in the Late Cretaceous period. This systematic review synthesizes the current understanding of the genetic and evolutionary trajectories within the Cucurbitaceae, tracing the lineage from ancestral forms to modern cultivars. We integrate findings from whole-genome analyses, phylogenetic studies, and gene family evolution research to construct a comprehensive picture of the genetic progress in this family. The review highlights the whole-genome duplication event in the Cucurbita  genus approximately 30 million years ago, which has led to a rapid turnover and neofunctionalization of protein-coding and long noncoding RNA genes, particularly in Cucurbita argyrosperma . Additionally, the evolution of Benincasa hispida  is examined, revealing its unique phylogenetic position and significant gene loss from its common ancestor, alongside the conservation of the phenylalanine ammonia-lyase gene family across six Cucurbitaceae species. The phylogenetic relationships within the family are clarified, with an emphasis on the major clades and their geographical distributions, as well as the need for further ecological and morphological studies. This review provides valuable insights into the genetic mechanisms underlying the diversity and adaptation of Cucurbitaceae species, offering a foundation for future research and breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,429
Score d'incertitude au seuil0,706

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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