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Enregistrement W4401507727 · doi:10.1101/2024.08.12.607560

Grape ripening speed slowed down using natural variation

2024· preprint· en· W4401507727 sur OpenAlexaff
Luigi Falginella, Gabriele Magris, Simone D. Castellarin, Gregory A. Gambetta, Mark A. Matthews, Michele Morgante, Gabriele Di Gaspero

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHorticultural and Viticultural Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRipeningRipenessVeraisonBerryViticultureBiologyHorticultureVitis viniferaCultivarWineFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Understanding ripening patterns and governing ripening speed are central aspects of grapevine ( Vitis vinifera ) berry biology owing to the importance of grape ripeness in winemaking. Despite this, the genetic control of ripening is largely unknown. Here, we report a major quantitative trait locus that controls ripening speed, expressed as speed of sugar accumulation. A haplotype originating from the species Vitis riparia halves maximum speed regardless of crop levels and berry sizes. The sequence of events that are normally completed at the onset of ripening in a two-week period known in viticulture as veraison are taking place at a slower speed, thereby attaining ripeness under milder weather conditions in late summer. V. vinifera cultivars show limited phenotypic variation for ripening speed and no selective sweep in the causal genomic region that could derive from domestication or improvement. Closely related species make up for the lack of standing variation, supplying major effect alleles for adapting grape cultivars to climate change. HIGHLIGHT / SIGNIFICANCE STATEMENT Reducing the speed of fruit ripening genetically is a means for adapting the grape berry developmental program to the changing needs of the wine industry and in response to global warming. We identified a haplotype in a wild grape species that slows down the speed of ripening in progenies of Vitis vinifera by limiting the speed of sugar accumulation throughout the duration of ripening, a condition of great importance for winemakers to harvest their grapes at the desired level of technological ripeness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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