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Enregistrement W4401686778 · doi:10.1093/sumbio/qvae021

Microbial antibiotic resistance genes across an anthropogenic gradient in a Canadian High Arctic watershed

2024· article· en· W4401686778 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueSustainable Microbiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensUniversité du Québec à ChicoutimiInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité LavalCenter for Northern Studies
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMetagenomicsBiologyWatershedEcologyAntibiotic resistanceMicrobial population biologyMicrobial ecologyHabitatTemperate climateArcticEffluentBacteriaAntibioticsEnvironmental scienceGeneMicrobiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Antibiotic resistance is one of the biggest challenges to public health. While the discovery of antibiotics has decreased pathogen-caused mortality, the overuse of these drugs has resulted in the increased transfer and evolution of antibiotic resistance genes (ARGs) in bacteria. ARGs naturally occur in wild bacterial communities, but are also found in increased concentrations in environments contaminated by wastewater effluent. Although such ARGs are relatively well described in temperate environments, little is known about the distribution and dissemination of these genes in the Arctic. We characterized the ARGs in microbial communities from aerosols, lakes and microbial mats around a remote Arctic hamlet using metagenomic approaches. Specific objectives were to (i) compare ARGs across habitats, (ii) to characterize ARG populations along a continuum of anthropogenically influenced environments, and (iii) to identify ARGs of viral origin. We identified ARGs in all habitats throughout the watershed, and found that microbial mats in the most impacted area had the highest diversity of ARGs relative to uncontaminated sites, which may be a remnant signal of wastewater effluent inputs in the area during the 20th century. Although we identified ARGs predominantly in bacterial genomes, our data suggests that mimiviruses may also harbor ARGs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,744
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle