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Enregistrement W4401697588 · doi:10.1101/2024.08.15.608043

Headwinds to Understanding Stress Response Physiology: A Systematic Review Reveals Mismatch between Real and Simulated Marine Heatwaves

2024· review· en· W4401697588 sur OpenAlexaff
Harmony A. Martell, Simon D. Donner

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpaceflight effects on biology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFight-or-flight responseStress (linguistics)BiologyGeneticsGenePhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Laboratory experiments have long been used to guide predictions of organismal stress in response to our rapidly changing climate. However, the ability to simulate real world conditions in the laboratory can be a major barrier to prediction accuracy, creating obstacles to efforts informing ecosystem conservation and management. Capitalizing on an extensive experimental literature of coral bleaching physiology, we performed a systematic review of the literature and assembled a database to identify the methods being used to measure coral bleaching in heating experiments and assess how closely heating experiments resembled marine heatwaves (MHWs) on coral reefs. Observations of the maximum photochemical yield of Photosystem II ( F V / F M ), though not a direct measure of bleaching, vastly outnumbered Symbiodiniaceae density and chlorophyll (μg cm -2 , pg cell -1 ) observations in the available literature, indicating the widespread misuse of F V / F M as a proxy for coral bleaching. Laboratory studies in our database used significantly higher maximum temperatures, degree heating times (∼ 1.7 ×) and heating rates (∼ 7.3 ×), and significantly shorter durations (∼ 1.5 ×), than MHWs on coral reefs. We then asked whether exposure differences between lab and reef altered the relationship between coral bleaching and heating metrics using the example of hormesis, the biphasic dose response wherein low to moderate doses elicit some benefit, while high doses are deleterious. We fit curves on the data both with and without ecologically relevant heating metrics and found hormetic curves in some response variables were altered with the exclusion of exposures that fell outside of the bounds of MHWs on coral reefs. Differences between lab exposures and real-world MHWs were large enough to alter the relationships, indicating a high likelihood of prediction error. We recommend laboratory-based studies of coral bleaching use ecologically relevant exposures to improve our predictions of the coral physiological response to our rapidly warming oceans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,005
Bibliométrie0,0130,012
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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