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Enregistrement W4401864402 · doi:10.22541/au.172457518.81003189/v1

Wet season environments drive local adaptation in the drought-sensitive timber tree Dicorynia guianensis in French Guiana

2024· preprint· en· W4401864402 sur OpenAlexaff
Julien Bonnier, Enrique Saez-Laguna, Thomas Francisco, Olivier Brunaux, Sylvain Schmitt, Stéphane Traissac, Niklas Tysklind, Myriam Heuertz

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensOntario Neurotrauma Foundation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMaladaptationLocal adaptationRainforestEcologyGeographyBiodiversityClimate changeAdaptation (eye)Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Climate change poses threats to biodiversity, particularly in tropical rainforests. How tropical rainforest tree species will respond to climate change is uncertain because their extent of local adaptation, its drivers and genetic basis remain poorly known. Characterizing these and the risks of maladaptation in future climates can inform on possible responses and help design strategies for the conservation. This study focuses on Dicorynia guianensis (Fabaceae), a widespread tree species in French Guiana, known for its sensitivity to drought. We performed genome resequencing on 87 individuals sampled in 11 sites across French Guiana to investigate the genetic structure, diversity, the drivers and the genetic basis of local adaptation. Genetic structure analysis identified three distinct groups: western, inland, and eastern, with similar levels of genetic diversity and distributed in areas with different environmental conditions. Six methods applied to detect genomic signatures of selection revealed region-specific selective sweeps and overlap between SNPs identified through outlier analysis or genome-environment association analyses. The most relevant environmental drivers of selection were potential evapotranspiration of the wettest quarter and precipitation of the coldest quarter, indicating that environmental variables related to high rainfall during the wet season are stronger drivers of local adaptation of D. guianensis than drought. Sites located in inland French Guiana had higher risks of climatic maladaptation than coastal sites. Our results contribute to the understanding of local adaptation and risk of maladaptation in tropical trees. They emphasize the need for area-specific approaches in managing tropical tree under the pressures of climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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