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Enregistrement W4401865674 · doi:10.1101/2024.08.23.605375

OPA1 mediates cardiac function and metabolism: in silico and in vivo evidence

2024· preprint· en· W4401865674 sur OpenAlexaff
Claire Fong-McMaster, Serena M. Pulente, Luke S Kennedy, Tyler K.T. Smith, Stephanie Myers, Michel Kanaan, Charbel Y Karam, Matthew Cope, Ilka Lorenzen‐Schmidt, Craig J. Goergen, Morgan D. Fullerton, Miroslava Čuperlović‐Culf, Erin E. Mulvihill, Mary‐Ellen Harper

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute of Infection and ImmunityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIn silicoIn vivoFunction (biology)Computational biologyMetabolismChemistryBiologyPharmacologyCell biologyBiochemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract OPA1 is an inner mitochondrial membrane protein that mediates diverse signaling processes. OPA1 is important for cardiac function and protects against cardiac insults such as ischemia reperfusion injury. We sought to further assess OPA1 in human and mouse cardiac pathologies, hypothesizing that OPA1 may also function in a protective manner in chronic heart failure. Bioinformatic analyses of histological and transcript data from the GTEx database indicated that OPA1 expression levels vary in the human heart, where elevated OPA1 transcript levels were correlated with fatty acid, branch chain amino acid and contractile gene signatures. To experimentally assess these correlations, mice with a 1.5-fold whole body OPA1 overexpression (OPA1-OE) were subjected to transverse aortic constriction surgery and displayed improved 2D and 4D cardiac functional parameters compared to WT mice. OPA1-OE mice had no induction of fibrotic transcript markers and displayed sustained transcript levels of fatty acid, branch chain amino acid and contractile markers. Maximal oxidative capacity was sustained in both WT and OPA1-OE cardiac myofibers post-TAC. These results further demonstrate the important role of OPA1 in mediating cardiac function and highlight protective signaling pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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