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Enregistrement W4401868171 · doi:10.3389/fncom.2024.1434421

Deep learning for detecting prenatal alcohol exposure in pediatric brain MRI: a transfer learning approach with explainability insights

2024· article· en· W4401868171 sur OpenAlexafffund
Anik Das, Kauê Tartarotti Nepomuceno Duarte, Catherine Lebel, Mariana Bento

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Computational Neuroscience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal and fetal brain pathology
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Children's Hospital Research InstituteKids Brain Health NetworkCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Innovates
Mots-clésPrenatal alcohol exposureTransfer of learningPrenatal exposureDeep learningComputer scienceArtificial intelligenceNeuroimagingNeurosciencePsychologyAlcoholPregnancyChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prenatal alcohol exposure (PAE) refers to the exposure of the developing fetus due to alcohol consumption during pregnancy and can have life-long consequences for learning, behavior, and health. Understanding the impact of PAE on the developing brain manifests challenges due to its complex structural and functional attributes, which can be addressed by leveraging machine learning (ML) and deep learning (DL) approaches. While most ML and DL models have been tailored for adult-centric problems, this work focuses on applying DL to detect PAE in the pediatric population. This study integrates the pre-trained simple fully convolutional network (SFCN) as a transfer learning approach for extracting features and a newly trained classifier to distinguish between unexposed and PAE participants based on T1-weighted structural brain magnetic resonance (MR) scans of individuals aged 2-8 years. Among several varying dataset sizes and augmentation strategy during training, the classifier secured the highest sensitivity of 88.47% with 85.04% average accuracy on testing data when considering a balanced dataset with augmentation for both classes. Moreover, we also preliminarily performed explainability analysis using the Grad-CAM method, highlighting various brain regions such as corpus callosum, cerebellum, pons, and white matter as the most important features in the model's decision-making process. Despite the challenges of constructing DL models for pediatric populations due to the brain's rapid development, motion artifacts, and insufficient data, this work highlights the potential of transfer learning in situations where data is limited. Furthermore, this study underscores the importance of preserving a balanced dataset for fair classification and clarifying the rationale behind the model's prediction using explainability analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,487
Score d'incertitude au seuil0,624

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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