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Enregistrement W4401897916 · doi:10.1101/2024.08.16.24312135

BMI-related Genetic Factors and COPD Imaging Phenotypes

2024· preprint· en· W4401897916 sur OpenAlexaff
Jingzhou Zhang, Matthew Moll, Catherine L. Debban, Brian D. Hobbs, Heena Rijhwani, George R. Washko, Bartolomé R. Celli, Edwin K. Silverman, Per Bakke, Elizabeth C. Oelsner, R. Graham Barr, Àlvar Agustí, Rosa Faner, Guy G. Bruselle, Stephen M. Humphries, David A. Lynch, Josée Dupuis, Ani Manichaikul, George O'connor, Michael H. Cho

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCOPDMedicineBody mass indexPercentileFramingham Heart StudyHounsfield scaleInternal medicineCardiologyAirwayPopulationObesityRadiologyFramingham Risk ScoreDiseaseComputed tomographySurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background While low body mass index (BMI) is associated with emphysema and obesity is associated with airway disease in chronic obstructive pulmonary disease (COPD), the underlying mechanisms are unclear. Methods We aggregated genetic variants from population-based genome-wide association studies to generate a polygenic score of BMI (PGS BMI ). We calculated this score for participants from COPD-enriched and community-based cohorts and examined associations with automated quantification and visual interpretation of computed tomographic emphysema and airway wall thickness (AWT). We summarized the results using meta-analysis. Results In the random-effects meta-analyses combining results of all cohorts (n=16,349), a standard deviation increase of the PGS BMI was associated with less emphysema as quantified by log-transformed percent of low attenuation areas ≤ 950 Hounsfield units (β= -0.062, p <0.0001) and 15 th percentile value of lung density histogram (β=2.27, p <0.0001), and increased AWT as quantified by the square root of wall area of a 10-mm lumen perimeter airway (β=0.016, p =0.0006) and mean segmental bronchial wall area percent (β=0.26, p =0.0013). For imaging characteristics assessed by visual interpretation, a higher PGS BMI was associated with reduced emphysema in both COPD-enriched cohorts (OR for a higher severity grade=0.89, p =0.0080) and in the community-based Framingham Heart Study (OR for the presence of emphysema=0.82, p =0.0034), and a higher risk of airway wall thickening in the COPDGene study (OR=1.17, p =0.0023). Conclusions In individuals with and without COPD, a higher body mass index polygenic risk is associated with both quantitative and visual decreased emphysema and increased AWT, suggesting genetic determinants of BMI affect both emphysema and airway wall thickening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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