BMI-related Genetic Factors and COPD Imaging Phenotypes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background While low body mass index (BMI) is associated with emphysema and obesity is associated with airway disease in chronic obstructive pulmonary disease (COPD), the underlying mechanisms are unclear. Methods We aggregated genetic variants from population-based genome-wide association studies to generate a polygenic score of BMI (PGS BMI ). We calculated this score for participants from COPD-enriched and community-based cohorts and examined associations with automated quantification and visual interpretation of computed tomographic emphysema and airway wall thickness (AWT). We summarized the results using meta-analysis. Results In the random-effects meta-analyses combining results of all cohorts (n=16,349), a standard deviation increase of the PGS BMI was associated with less emphysema as quantified by log-transformed percent of low attenuation areas ≤ 950 Hounsfield units (β= -0.062, p <0.0001) and 15 th percentile value of lung density histogram (β=2.27, p <0.0001), and increased AWT as quantified by the square root of wall area of a 10-mm lumen perimeter airway (β=0.016, p =0.0006) and mean segmental bronchial wall area percent (β=0.26, p =0.0013). For imaging characteristics assessed by visual interpretation, a higher PGS BMI was associated with reduced emphysema in both COPD-enriched cohorts (OR for a higher severity grade=0.89, p =0.0080) and in the community-based Framingham Heart Study (OR for the presence of emphysema=0.82, p =0.0034), and a higher risk of airway wall thickening in the COPDGene study (OR=1.17, p =0.0023). Conclusions In individuals with and without COPD, a higher body mass index polygenic risk is associated with both quantitative and visual decreased emphysema and increased AWT, suggesting genetic determinants of BMI affect both emphysema and airway wall thickening.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».