Intergeneric chromosome-specific painting reveals differential chromosomal transmission from Tripidium arundinaceum in sugarcane progeny
Notice bibliographique
Résumé
Sugarcane has recently attracted increasing attention for its potential as a source of sugar and bioethanol, so increasing its yield is essential to ensure the sugar security and bioenergy production. Intergeneric hybridization is a highly efficient method to produce new genetic variants of crop plants, particularly those species with high ploidy such as sugarcane ( Saccharum spp.). Tripidium arundinaceum exhibits many desirable agronomic traits, and has been widely studied to produce hybrids with improved stress tolerance and other characteristics in sugarcane breeding. However, the genetic relationship between T. arundinaceum and Saccharum species, and the individual T. arundinaceum chromosomal compositions in sugarcane hybrids are still elusive. Here we used whole-genome single-nucleotide polymorphisms (SNPs) to ascertain the phylogenetic relationships between these species and found that T. arundinaceum is more closely related to Saccharum than Sorghum , in contrast to the previous narrow genetic analyses using chloroplast DNA. Additionally, oligonucleotide (oligo)-based chromosome-specific painting derived from Saccharum officinarum was able to distinctly identify the chromosomes of T. arundinaceum . We developed the oligo-genomic in situ hybridization (GISH) system for the first time, to unveil the novel chromosome translocations and the transmission of individual T. arundinaceum chromosomes in sugarcane progeny. Notably, we discovered that the chromosomal transmission of T. arundinaceum exhibited several different inheritance modes, including n, 2n, and over 2n in the BC 1 progenies. Such inheritance patterns may have resulted from first division restitution (FDR) or FDR+nondisjunction of a chromosome with the sister chromatids in the second meiosis division/second division restitution (FDR+NSC/SDR) model during meiosis. These results will be of substantial benefit for the further selection of T. arundinaceum chromosomes for sugarcane genetic improvement.
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Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».