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Enregistrement W4401996983 · doi:10.1063/5.0221207

Multiple dynamic modes of Bicoid morphogen gradient are explained by a quantum-classical model

2024· article· en· W4401996983 sur OpenAlexaff
Irfan Lone, Carl Trindle

Notice bibliographique

RevueAIP Advances · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensCanadian Quantum Research Center
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMorphogenQuantumPhysicsDrosophila embryogenesisStatistical physicsQuantum mechanicsBiologyGeneticsEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Extracellular diffusion coupled with degradation is considered a dominant mechanism behind the establishment of morphogen gradients. However, the fundamental nature of these biophysical processes, visa viz, the Bicoid (Bcd) morphogen gradient, remains unclear. Fluorescence correlation spectroscopy has recently revealed multiple modes of Bcd transport at different spatial and temporal locations across the embryo. Here, we show that these observations are best fitted by a model fundamentally based on quantum mechanics. It is thus hypothesized that the transient quantum coherences in collaboration with unitary noise are responsible for the observed dynamics and relaxation to a non-equilibrium steady-state of the Bcd morphogen gradient. Furthermore, simulating the associated probability distribution for the model shows that the observed non-zero concentration of the Bcd molecules in the posterior-most parts of the embryo is a result of non-Gaussian distribution characteristic to quantum evolution. We conclude that with the Bcd gradient being essentially a one-dimensional problem, a simple one-dimensional model suffices for its analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
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Résumé présentoui

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