Dissecting the Enterococcal Polysaccharide Antigen (EPA) structure to explore innate immune evasion and phage specificity
Notice bibliographique
Résumé
Streptococci, Lactococci and Enterococci all produce L-rhamnose-containing cell wall polysaccharides which define Lancefield serotypes and represent promising candidates for the design of glycoconjugate vaccines. The L-rhamnose containing Enterococcal Polysaccharide Antigen (EPA), produced by the opportunistic pathogen Enterococcus faecalis, plays a critical role in normal growth, division, biofilm formation, antimicrobial resistance, phage susceptibility, and innate immune evasion. Despite the critical role of this polymer in E. faecalis physiology and host-pathogen interactions, little information is available on its structure and biosynthesis. Here, using an NMR approach, we elucidate the structure of EPA and propose a model for biosynthesis. We report the structure of the EPA-peptidoglycan linkage unit and reveal an unprecedented complexity of the EPA rhamnose backbone and decoration subunits. Finally, we explore the impact of several EPA structural modifications on innate immune evasion and recognition by bacteriophages. This work represents a first step towards the functional characterisation of EPA and the rational design of therapeutic strategies against a group of important pathogens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».