First report of <i>Diaporthe humulicola</i> causing halo blight of hop ( <i>Humulus lupulus</i> L.) in Prince Edward Island, Canada
Notice bibliographique
Résumé
This study documents the first report of halo blight of hop (Humulus lupulus L.), caused by the fungal pathogen Diaporthe humulicola, in Prince Edward Island (PE), Canada. This pathogen has been previously reported in Michigan, New York, Connecticut and Quebec. Disease symptoms were reported in hopyards in Harrington and Mount Albion, PE. Symptoms reported include both foliar lesions and severe necrosis of hop cones. Through a metagenomic approach using Nanopore sequencing of the full Internal Transcribed Spacer (ITS) region products, multiple fungal species were identified in infected hop cones. Many plant pathogens were present in the hop cones including species of Botrytis, Alternaria, Colletotrichum and Fusarium. Additionally, metagenomic sequencing identified reads that most closely matched D. humulicola. Symptomatic leaf tissue sections were cultured on amended PDA to isolate the pathogen, then colony PCR was conducted and ITS regions were sequenced, confirming the identity of D. humulicola. Pathogenicity was validated using Koch’s postulates on hop leaf disks, with lesion development occurring 7 days post-inoculation. Considering the humid conditions characteristic of eastern North American hop-growing zones, halo blight’s emergence in PE emphasizes the need for comprehensive monitoring and improved best management strategies to protect the PE hop industry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».