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Enregistrement W4402171015 · doi:10.1053/j.gastro.2024.08.031

Healthy First-Degree Relatives From Multiplex Families vs Simplex Families Have Higher Subclinical Intestinal Inflammation, a Distinct Fecal Microbial Signature, and Harbor a Higher Risk of Developing Crohn’s Disease

2024· article· en· W4402171015 sur OpenAlexafffund
Pablo A. Olivera, Helena Martínez-Lozano, Haim Leibovitzh, Mingyue Xue, Anna Neustaeter, Osvaldo Espin‐Garcia, Wei Xu, Karen Madsen, David S. Guttman, Çharles N. Bernstein, Baruch Yerushalmi, Jeffrey S. Hyams, Maria T. Abreu, John K. Marshall, Iwona Wrobel, David R. Mack, Kevan Jacobson, Alain Bitton, Guy Aumais, Remo Panacionne, Levinus A. Dieleman, Mark S. Silverberg, A. Hillary Steinhart, Paul Moayyedi, Dan Turner, Anne M. Griffiths, Williams Turpin, Kenneth Croitoru

Notice bibliographique

RevueGastroenterology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenHôpital Maisonneuve-RosemontBC Children's HospitalMcGill University Health CentreUniversity of OttawaGenome CanadaChildren's Hospital of Eastern OntarioMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of CalgaryUniversity of ManitobaPublic Health OntarioUniversity of TorontoHealth Sciences CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCrohn's and Colitis CanadaLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable Trust
Mots-clésSubclinical infectionFecesCrohn's diseaseDiseaseMedicineMultiplexFirst-degree relativesImmunologyInternal medicineBiologyMicrobiologyFamily historyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND & AIMS: Unaffected first-degree relatives (FDRs) from families with ≥2 affected FDRs with Crohn's disease (CD, multiplex families) have a high risk of developing CD, although the underlying mechanisms driving this risk are poorly understood. We aimed to identify differences in biomarkers between FDRs from multiplex vs simplex families and investigate the risk of future CD onset accounting for potential confounders. METHODS: We assessed the Crohn's and Colitis Canada Genetic Environmental Microbial cohort of healthy FDRs of patients with CD. Genome-wide CD-polygenic risk scores, urinary fractional excretion of lactulose-to-mannitol ratio, fecal calprotectin (FCP), and fecal 16S ribosomal RNA microbiome were measured at recruitment. Associations between CD multiplex status and baseline biomarkers were determined using generalized estimating equations models. Cox models were used to assess the risk of future CD onset. RESULTS: There were 4051 participants from simplex families and 334 from CD multiplex families. CD multiplex status was significantly associated with higher baseline FCP (P = .026) but not with baseline CD-polygenic risk scores or the lactulose-to-mannitol ratio. Three bacterial genera were found to be differentially abundant between both groups. CD multiplex status at recruitment was independently associated with an increased risk of developing CD (adjusted hazard ratio, 3.65; 95% confidence interval, 2.18-6.11, P < .001). CONCLUSION: Within FDRs of patients with CD, participants from multiplex families had a 3-fold increased risk of CD onset, a higher FCP, and an altered bacterial composition, but not genetic burden or altered gut permeability. These results suggest that putative environmental factors might be enriched in FDRs from multiplex families.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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