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Enregistrement W4402187008 · doi:10.1101/2024.09.02.24312942

High levels of IsoDGR-modified fibronectin are associated with higher levels of macrophages and other rupture-prone plaque characteristics in patients undergoing carotid endarterectomy

2024· preprint· en· W4402187008 sur OpenAlexaff
Tetiana Motsak, Barend M. Mol, Joost Hoekstra, Valentina Osorio Zuluaga, Saskia Rumpff-Derksen, Ioanna Paspali-Strik, Sofon Cam Ngan, Gerard Pasterkamp, Gert J. de Borst, Siu Kwan Sze, Dominique P.V. de Kleijn

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFibronectinCarotid endarterectomyMacrophageEndarterectomyMedicinePathologyImmunohistochemistryStainingInternal medicineChemistryExtracellular matrixCarotid arteriesIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Deamidation of the NGR (Asn-Gly-Arg) motif to the isoDGR (isoAsp-Gly-Arg) motif in fibronectin (IsoDGR-fibronectin) enhances in vitro monocyte and endothelial cell activation. Blocking isoDGR reduces macrophage influx in murine tissues. Although macrophage influx is an important feature of human plaque destabilization, the role for plasma and plaque isoDGR-fibronectin in macrophage influx in the atherosclerotic plaque and thereby increasing plaque vulnerability has not been investigated in large human cohorts. Design: IsoDGR-fibronectin levels in plasma and plaques were measured in carotid endarterectomy (CEA) patients from the Athero Express biobank cohort and associated with macrophage and other vulnerable plaque characteristics in the carotid plaque of the same patient. Methods: Levels of isoDGR-fibronectin were measured using an ELISA. Carotid plaque characteristics were visualized with immunohistochemistry staining and scored semi-quantitatively. Baseline characteristics were analysed with Pearson`s Chi-squared test and Mann-Whitney U-test when applicable. Univariate and multivariate logistics regression analyses were used to identify associations with adverse plaque characteristics. Results: Plasma isoDGR-fibronectin was measured in 730 CEA patients. Patients with moderate/heavy plaque macrophage staining had higher levels of isoDGR-fibronectin than patients with no/minor macrophage staining (multivariate OR 1.40 (95%CI 1.04-1.90, p=0.028)). Of the 730 CEA patients, 348 had plaque samples available for isoDGR-fibronectin measurements. In the multivariate analysis, higher plaque levels of isoDGR-fibronectin were associated with moderate/high plaque macrophage staining (OR 1.22 (95%CI 1.00-1.56, p=0.049)), >40% fat in plaque (OR 1.1.44 (95% CI 1.14-1.86, p=0.004)) and intraplaque haemorrhage (OR 1.38 (95% 1.12-1.72, p=0.003)). Conclusion: In this large human cohort study high plasma and plaque levels of isoDGR-fibronectin were associated with more plaque macrophages and other adverse plaque characteristics. This suggests the involvement of isoDGR-fibronectin in human plaque destabilization that may lead to new potential treatment modalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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