MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4402321939 · doi:10.1101/2024.09.05.611543

Kinesin-8 motors dimerize by folding their proximal tail domain into a compact helical bundle

2024· preprint· en· W4402321939 sur OpenAlexaff
Daria Trofimova, Caitlin Doubleday, Byron Hunter, Jesus Serrano Arevalo, E. C. DAVISON, Kim Munro, John S. Allingham

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBundleKinesinFolding (DSP implementation)Molecular motorDomain (mathematical analysis)PhysicsBiophysicsHelix bundleCrystallographyChemistryMicrotubuleMaterials scienceBiologyNuclear magnetic resonanceProtein structureMathematicsEngineeringCell biologyMechanical engineeringMathematical analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Kinesin-8 motor proteins help align and segregate chromosomes during mitosis by regulating the dynamics of kinetochore-attached microtubules and the length and position of the mitotic spindle. Some kinesin-8 isoforms accomplish these roles by operating as multifunctional mechanoenzymes that can traverse microtubules, accumulate at the microtubule plus-ends, and then remove terminal αβ-tubulin subunits. While these activities are mainly powered by the motor domain, whose unique structure-function relationships have been recently reported, the non-motor tail domain contains integral functional elements that have not been structurally illuminated. Using the Candida albicans Kip3 protein as a kinesin-8 model system, we present an X-ray crystal structure and hydrodynamic data showing how the motor domain-proximal segment of the tail directs the assembly of two kinesin-8 polypeptides into a homodimer that forms the stalk of this motor. Unlike the extended coiled coil-forming helices of most other motile kinesin stalks, the proximal tail of Ca Kip3 folds into a compact 92 Å-long four-helix bundle that dimerizes. The first and third helices provide most of the surface area for the dimer interface, while the other two helices brace the folded stalk structure. The upper and lower lobules of the helical bundle are separated by a flexible hinge that gives the exterior faces of the stalk slightly different shapes when bent. We propose that these unique characteristics provide structural rigidity to the kinesin-8 stalk, as well as sites for transient interactions with kinesin-8-associated proteins or other regulatory regions of the motor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetMicrotubule and mitosis dynamics→Travaux en français237 207→