MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402402563 · doi:10.1101/2024.09.05.611506

Increasing prevalence of plant-fungal symbiosis across two centuries of environmental change

2024· preprint· en· W4402402563 sur OpenAlexaff
Joshua C. Fowler, Jacob K. Moutouama, Tom E. X. Miller

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSymbiosisEnvironmental changeGeographyBiologyEcologyClimate change

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Species' distributions and abundances are shifting in response to climate change. Most species harbor microbial symbionts that have the potential to influence these responses. Mutualistic microbial symbionts may provide resilience to environmental change by protecting their hosts from increasing stress. However, environmental change that disrupts these interactions may lead to declines in hosts or symbionts. Microbes preserved within herbarium specimens offer a unique opportunity to quantify changes in microbial symbiosis across broad temporal and spatial scales. We asked how the prevalence of seed-transmitted fungal symbionts of grasses (Epichloe endophytes), which can protect hosts from abiotic stress, have changed over time in response to climate change, and how these changes vary across host species' ranges. Specifically, we analyzed 2,346 herbarium specimens of three grass host species collected over the last two centuries (1824 -- 2019) for the presence or absence of endophyte symbiosis, and evaluated spatial and temporal trends in endophyte prevalence. We found that endophytes increased in prevalence over the last two centuries from ca. 25% prevalence to ca. 75% prevalence, on average, across three host species. We also found that changes in prevalence were associated with observed changes in seasonal climate drivers; notably increasing precipitation corresponding to each host species' peak growing season and changes in off-peak season variability in precipitation. Our analysis performed favorably in an out-of-sample predictive test with contemporary data, however we identified greater local-scale variability in endophyte prevalence in contemporary data compared to historic data, suggesting that model fusion may be an important step moving forward. Our results provide novel evidence for a cryptic biological response to climate change that may contribute to the resilience of host-microbe symbiosis through context-dependent benefits that confer a fitness advantage to symbiotic hosts under environmental change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetNematode management and characterization studiesTravaux en français237 207