MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402452090 · doi:10.5376/jtsr.2024.14.0008

Unlocking the Tea Genome: Advances in High-Quality Sequencing and Annotation

2024· article· en· W4402452090 sur OpenAlexvenueno aff
Xi Chen, Yichen Zhao

Notice bibliographique

RevueJournal of Tea Science Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGuizhou Academy of Agricultural SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAnnotationComputational biologyDNA sequencingBiologyGenomeGenome projectQuality (philosophy)Computer scienceGeneticsDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study explores the latest advancements in high-quality sequencing and annotation of the tea plant genome, revealing its genetic diversity, regulatory mechanisms, and biotechnological applications.Through comprehensive genomic analysis, significant discoveries have been made, including the assembly of the complex tea plant genome, key genes regulating the synthesis of bioactive compounds (such as catechins and caffeine), and epigenetic regulatory mechanisms influencing tea plant phenotypes and environmental adaptability.Comparative genomics studies have elucidated the relationships between tea cultivars and their wild relatives, enhancing the understanding of genetic variation and adaptive traits.These findings highlight the potential of tea genomics in precision breeding, which can be used to develop climate-resistant cultivars, improve tea quality, and diversify market products.The advancements in high-quality sequencing and annotation of the tea plant genome have significantly improved our understanding of the genetic and metabolic bases of tea quality.These discoveries provide valuable resources for future research and breeding programs aimed at improving tea plant varieties and expanding the diversity of tea flavors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,361 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Tea Science ResearchMême sujetPlant Pathogens and Fungal DiseasesTravaux en français237 207