Protein-Templated Click Ligation Reaction Triggered by Protein-Split Aptamer Interactions
Notice bibliographique
Résumé
DNA-templated reactions have found wide applications in sensing and drug discovery. However, this strategy has been limited to the use of nucleic acids as templating elements to direct the proximity effect. Herein, we describe a versatile p rotein- t emplated sp lit a ptamer c lick l igation r eaction (PT-SpA-CLR) in which the protein template-induced covalent proximity ligation of split aptamer elements enables translating protein/aptamer binding events into the output of ligated DNA products. A ligation yield of >80% is observed for three model protein templates, including VEGF 165, PDGF-BB, and SARS-CoV-2 S1. The ligation reaction compensates for the weakness of reduced binding affinity resulting from splitting the aptamer, as evidenced by an approximately 2-fold lower dissociation constant than the non-ligated system. This newly developed PT-SpA-CLR strategy is further integrated with colorimetric or fluorescent reporting mechanisms to achieve easy-to-use and low-cost biosensors utilizing ligation to produce a fully active G-quadruplex or an RNA-cleaving DNAzyme to report protein binding. Both assays can achieve specific detection of an intended protein target with a limit of detection at the picomolar level even when challenged in biological samples. The combined PT-SpA-CLR and versatile sensing strategies offer attractive universal platforms for efficient detection of protein biomarkers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».