Case report: Early (molecular) diagnosis is the clue: report on ALDH7A1 deficiency in newborns
Notice bibliographique
Résumé
The first-tier genetic testing for developmental and epileptic encephalopathies (DEE) is now increasingly used in routine clinical practice. Antiquitin deficiency, also referred to as pyridoxine-dependent epilepsy (PDE-ALDH7A1), represents an inherited metabolic disorder with the phenotype of an early infantile DEE. In addition to the fact that biochemical biomarkers of PDE-ALDH7A1, including α-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase, pipecolic acid (PA), Δ1-piperideine-6-carboxylate, and 6-oxopipecolate (6-oxo-PIP), are well-characterized, and their analysis and usefulness have some limitations. Here, we describe the case of a newborn presenting with seizures from the first hours of life, who was resistant to standard antiepileptic drugs and was found to be a biallelic compound heterozygote of two clearly pathogenic variants in the ALDH7A1 gene based on targeted next-generation sequencing (NGS). The diagnostic process of PDE-ALDH7A1 was limited by the possibility to determine only urinary PA and 6-oxo-PIP (urinary organic acid profile using the GC–MS method), and the exogenous peak of levetiracetam, due to the fact that it has a similar retention time as 6-oxo-PIP, masked the detection of 6-oxo-PIP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».