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Enregistrement W4402519542 · doi:10.1080/07352689.2024.2396259

Apomixis in Systematics, Evolution and Phylogenetics of Angiosperms: Current Developments and Prospects

2024· article· en· W4402519542 sur OpenAlexaff
Elvira Hörandl, Diego Hojsgaard, Ana D. Caperta, Sofia I. R. Conceição, Ana Sofia Rõis, Timothy A. Dickinson, Terezie Mandáková, Michael D. Windham, Marc S. Appelhans, Patrik Mráz, Jindřich Chrtek

Notice bibliographique

RevueCritical Reviews in Plant Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Taxonomy and Phylogenetics
Établissements canadiensRoyal Ontario MuseumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesFundação para a Ciência e a TecnologiaGrantová Agentura České RepublikyDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésApomixisSystematicsPhylogeneticsBiologyEvolutionary biologyBotanyTaxonomy (biology)GeneticsPloidyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Apomixis, the reproduction via asexually formed seed, is taxonomically scattered in angiosperms. Here we review the major developmental pathways to apomixis and the occurrences on the level of orders and families. We provide surveys of large families for which occurrences and evolutionary pathways of apomixis are well documented (Poaceae, Ranunculaceae, Plumbaginaceae, Rosaceae, Brassicaceae, Rutaceae, and Asteraceae). Molecular phylogenetic, phylogenomic, and cytogenetic studies have confirmed that apomixis frequently arises in hybrids, with or without polyploidy. Multiple origins, different developmental pathways, and genetic/epigenetic control mechanisms confirm that apomixis is a derived trait. Pollen functions are in many taxa maintained for fertilization of polar nuclei and proper endosperm development, which allows also for maintenance of facultative sexuality and further intercrossing of lineages. This way, apomixis often results in huge and dynamic complexes of numerous hybrid genotypes and phenotypes with highly reticulate relationships. Such complexes are successful to establish in various habitats and geographical regions. Expression of apomixis appears to be in some genera influenced by environmental conditions. The diversity of evolutionary pathways is reflected in various, genus-wise taxonomic treatments. Future research is needed to understand the short-term evolutionary dynamics, the functional background for apomixis, and the long-term evolutionary fates of apomictic lineages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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