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Enregistrement W4402526322 · doi:10.1016/j.isci.2024.110947

Artificial antigen-presenting cell system reveals CD28’s role in modulating T cell functions during human immunodeficiency virus infection

2024· article· en· W4402526322 sur OpenAlexafffund
Tayma Shaaban Kabakibo, Edwige Arnold, Kartika Padhan, Audrée Lemieux, Gloria Gabrielle Ortega-Delgado, Jean‐Pierre Routy, Naglaa H. Shoukry, Mathieu Dubé, Daniel E. Kaufmann

Notice bibliographique

RevueiScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthCanada Foundation for InnovationNational Heart, Lung, and Blood InstituteMcGill University
Mots-clésHuman immunodeficiency virus (HIV)AntigenCD28T cellCellCell biologyBiologyImmunologyComputational biologyChemistryVirologyImmune systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

T cell immune dysfunction is a prominent feature of chronic HIV infection. To evaluate non-specific dysfunction, a method involving both generic activation and T cell receptor (TCR) stimulation is necessary. We created a tunable artificial antigen-presenting cell (aAPC) system. This system consists of lipid bilayers on cytometry-compatible silica microbeads (5 μm). When only anti-CD3 is incorporated, T cell activation is limited. Introducing anti-CD28 agonists significantly elevates the cytokine expression and upregulation of activation-induced markers. CD28 co-stimulation modulates the response profile, preferentially promoting IL-2 expression relative to other cytokines. aAPCs-stimulated CD4 + and CD8 + T cells from untreated HIV-infected individuals exhibit altered effector functions and diminished CD28 dependence. These functions are skewed toward TNFα, IFNγ and CD107a, with reduced IL-2. Antiretroviral therapy partially normalizes this distorted profile in CD4 + T cells, but not in CD8 + T cells. Our findings show T cell intrinsic biases that may contribute to persistent systemic T cell dysfunction associated with HIV pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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