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Enregistrement W4402542038 · doi:10.1093/jas/skae234.437

478 Impact of crude protein and phosphorus deficiencies on liver mitochondrial content and transcriptome in growing Merino wethers

2024· article· en· W4402542038 sur OpenAlexaff
Elmer A. Fernández, Nicholas J. Hudson, David Innes, S. P. Quigley, Dennis Poppi

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueConstructed Wetlands for Wastewater Treatment
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomePhosphorusBiologyAnimal scienceChemistryBiochemistryGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In grazing systems in Northern Australia, crude protein (CP) and phosphorus (P) availability varies, affecting ruminant production due to voluntary reduced intake and therefore body weight (BW) gain. We were interested in understanding metabolic regulation in this model system, both in terms of a) identifying key tissues, and b) detecting any modifications in mitochondrial physiology, given the central role of this organelle in bioenergetic homeostasis. Merino wethers (n = 24) were subjected to three dietary regimens: High CP, High P, (Control), Low CP, Low P (Deficient), and High CP, High P, with restricted feed intake (Restricted). Mitochondrial DNA (mtDNA) copy numbers, indicative of mitochondrial content, were measured via qPCR. Transcriptomic analyses through RNA sequencing targeted mitochondria-associated gene expression changes and pathways, using the MitoCarta 3.0 database. There was a significant decrease of mtDNA copy numbers in the liver of sheep under either Deficient and Restricted diets (P < 0.01), with as much as a 2-fold difference between the Control and Deficient diets. This may suggest reduced mitochondrial biogenesis as an adaptation to decreased energy intake. When compared with the Control group, both the Deficient and Restricted groups upregulated pathways related to vitamin metabolism (Log2FC: 0.231 and 0.449) and folate and 1-C metabolism (Log2FC: 0.409 and 0.706). However, impacted pathways shared between these two comparisons (Control v Deficient, Control v Restricted) also include choline and betaine metabolism, amino acid metabolism, and glycine metabolism, which suggests similar mechanisms being impacted by decreased energy intake, regardless of whether it is due to satiety from nutrient deficiency or restricted feed intake. Notably, the creatine metabolism pathway was uniquely upregulated in the Restricted group compared with the Deficient group (Log2FC: 0.114), although the CKMT2 gene was upregulated in the Restricted group compared with both the Control and Deficient group (Log2FC: 1.30 and 0.879). Additionally, the SLC25A family pathway, responsible for mitochondrial metabolite transport, was found to be upregulated in the Restricted group when compared with both Control and Deficient groups (Log2FC: 0.33 and 0.865). Overall, this study demonstrated a pronounced decrease in mitochondrial content in the liver of growing Merino wethers subjected to nutritional deficiencies and feed restriction. Multiple metabolic pathways were shared between the comparisons of the Control diet group to both Deficient and Restricted nutritional treatments. However, the SLC25A transporter family pathway was uniquely upregulated in the Restricted group compared with either an optimal or deficient diet. The regulation of these metabolic pathways is a subject of further study that may represent a systemic response to maintain homeostasis while undergoing significantly lower energy intake, with implications for animal growth, tissue deposition, and energetic maintenance. Understanding distinctions in the response to feed restriction and nutrient deficiency induced reduction in intake may help improve production strategies for ruminants grazing in these conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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