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Enregistrement W4402542683 · doi:10.60087/jklst.v3.n4.p108

Advancements in sequencing technologies:

2024· article· en· W4402542683 sur OpenAlexaff
Iftakhar Kazim, Tanvi Gande, Elinor Reyher, Kelsang Gyatsho Bhutia, Karan Dhingra, Saloni Verma

Notice bibliographique

RevueJournal of Knowledge Learning and Science Technology ISSN 2959-6386 (online) · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputational biologyComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Single-cell Sequencing (SCS) technologies, methods for analyzing genetic material at the single-cell level, offer extensive insights into cellular heterogeneity. This has broadened oncology research by enabling the exploration of functional and genetic diversity within tissues of different cell types. Furthermore, SCS facilitates the study of complex biological processes like metastasis tracking and tumor microenvironment analysis. However, the implementation of SCS methods is furrowed by a lack of clinical accessibility and high application costs. This review examines the development of SCS technologies, analyzing trends in throughput, accessibility, and cost of various commercial platforms, by focusing on the domain of cancer research and precision medicine. Despite the significant advancements offered by third-generation sequencing platforms, which provide high accuracy, versatility, and throughput for sequencing single-cell genetic information, these methods face challenges such as high error rates, insufficient funding, and complex data analysis. Furthermore, we’ve determined that the advancements of the previous decade have enabled personalized medicine and in-depth analysis of cellular heterogeneity, revolutionizing fields like medicine, biotechnology, and biological research. We anticipate our assay indicating extensive advancements in healthcare through the adoption of precision medicine concerning individual genomes and helping to demonstrate the promise of advancement in general understandings of complex biological systems. Furthermore, our research indicates that efforts to overcome technical, analytical, and cost-related challenges are essential in future clinical application, distribution, and growth of SCS methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,389
Score d'incertitude au seuil0,633

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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