MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402580281 · doi:10.1094/phyto-02-24-0064-r

<i>Plasmodiophora brassicae</i> Effector PbPE23 Induces Necrotic Responses in Both Host and Nonhost Plants

2024· article· en· W4402580281 sur OpenAlexafffund
Md Musharaf Hossain, Edel Pérez López, Christopher D. Todd, Yangdou Wei, Peta C. Bonham‐Smith

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCanola Council of CanadaWestern Grains Research Foundation
Mots-clésBiologyHost (biology)EffectorClubrootBotanyHost responseHost resistanceGeneticsCell biologyImmunologyImmune systemBrassica

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plasmodiophora brassicae is an obligate biotroph that causes clubroot disease in cruciferous plants, including canola and Arabidopsis. In contrast to most known bacterial, oomycete, and fungal pathogens that colonize at the host apoplastic space, the protist P. brassicae establishes an intracellular colonization within various types of root cells and secretes a plethora of effector proteins to distinct cellular compartments favorable for the survival and growth of the pathogen during pathogenesis. Identification and functional characterization of P. brassicae effectors has been hampered by the limited understanding of this unique pathosystem. Here, we report a P. brassicae effector, PbPE23, containing a serine/threonine kinase domain, that induces necrosis after heterologous expression by leaf infiltration in both host and nonhost plants. Although PbPE23 is an active kinase, the kinase activity itself is not required for triggering necrosis in plants. PbPE23 shows a nucleocytoplasmic localization in Nicotiana benthamiana, and its N-terminal 25 TPDPAQKQ 32 sequence, resembling the contiguous hydrophilic TPAP motif and Q-rich region in many necrosis and ethylene inducing peptide 1-like proteins from plant-associated microbes, is required for the induction of necrosis. Furthermore, transcript profiling of PbPE23 reveals its high expression at the transition stages from primary to secondary infection, suggesting its potential involvement in the development of clubroot disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,940
Score d'incertitude au seuil0,277

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePhytopathologyMême sujetPlant Disease Resistance and GeneticsTravaux en français237 207