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Enregistrement W4402652073 · doi:10.1080/23818107.2024.2400654

Transcriptomic analysis reveals differential gene expression patterns during cannabis leaf morphogenesis and phase transition

2024· article· en· W4402652073 sur OpenAlexafffund
Mohsen Hesami, Marco Pepe, Maxime de Ronne, Mohsen Yoosefzadeh-Najafabadi, Kristian Adamek, Davoud Torkamaneh, Andrew Maxwell Phineas Jones

Notice bibliographique

RevueBotany Letters · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTranscriptomeMorphogenesisGeneBiologyGene expressionDifferential (mechanical device)GeneticsCannabisTransition (genetics)Gene expression profilingEvolutionary biologyComputational biologyCell biologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the molecular mechanisms governing leaf morphogenesis and phase transition in Cannabis sativa is critical for optimizing its growth, development and yield. In this study, we conducted a comparative transcriptomic analysis to investigate the gene expression patterns associated with leaf development and the transition from vegetative to reproductive phases in cannabis plants. Following germination, cannabis plants display a distinct leaf developmental pattern. While the specific number of leaflets varies among cultivars, here we focused on the White Widow cultivar as a model. It showed an increase in the number of serrated leaflets from one (L1) to nine (L5) in a node-specific manner. Subsequently, the number of leaflets decreased from eight (L6) to three (L9). The transition from vegetative to reproductive phases, marked by the appearance of solitary flowers and a shift from opposite to alternate leaf phyllotaxy, occurred at node 7 and node 12, respectively. Analysis of gene expression revealed 1358 differentially expressed genes, with 1,182 genes showing differential expression across all leaves. Notably, several genes involved in leaf morphogenesis (e.g. YAB, AGO5, and TCP4) were found to be upregulated in compound leaves (L2) compared to simple leaves (L1), implying a role in leaflet formation and overall leaf morphology. Furthermore, several genes associated with phase transition and flowering (e.g. SPLs, ELFs, SOC1, and CEN-Like) exhibited specific expression patterns during the transition from vegetative to reproductive phases. These findings provide valuable insights into the genetic regulation of leaf morphogenesis and phase transition in cannabis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,361
Score d'incertitude au seuil0,283

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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