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Enregistrement W4402664594 · doi:10.1038/s41467-024-52298-2

CYP1B1-RMDN2 Alzheimer’s disease endophenotype locus identified for cerebral tau PET

2024· article· en· W4402664594 sur OpenAlexfundno aff
Kwangsik Nho, Shannon L. Risacher, Liana G. Apostolova, Paula J. Bice, Jared R. Brosch, Rachael Deardorff, Kelley Faber, Martin R. Farlow, Tatiana Foroud, Sujuan Gao, Thea Rosewood, Jun Pyo Kim, Kelly Nudelman, Meichen Yu, Paul Aisen, Reisa A. Sperling, Basavaraj Hooli, Sergey Shcherbinin, Diana Otero Svaldi, Clifford R. Jack, William J. Jagust, Susan Landau, Aparna Vasanthakumar, Jeffrey F. Waring, Vincent Doré, Simon M. Laws, Colin L. Masters, Tenielle Porter, Christopher C. Rowe, Victor L. Villemagne, Logan Dumitrescu, Timothy J. Hohman, Julia B. Libby, Elizabeth C. Mormino, Rachel F. Buckley, Keith A. Johnson, Hyun‐Sik Yang, Ronald C. Petersen, Vijay K. Ramanan, Nilüfer Ertekin‐Taner, Prashanthi Vemuri, Ann D. Cohen, Kang-Hsien Fan, M. Ilyas Kamboh, Oscar L. López, David A. Bennett, Muhammad Ali, Tammie L.S. Benzinger, Carlos Cruchaga, Diana A. Hobbs, Philip L. De Jager, Masashi Fujita, Vaishnavi Jadhav, Bruce T. Lamb, Andy P. Tsai, Isabel Castanho, Jonathan Mill, Michael W. Weiner

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesLawrence Berkeley National LaboratoryNational Center for Research ResourcesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchGenentechNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesH. Lundbeck A/SEisaiGHR FoundationChan Zuckerberg InitiativeNorthern California Institute for Research and EducationRush UniversityServierSchuler-StiftungCurePSPU.S. National Library of MedicineNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIXICOUniversity of PittsburghPfizerBiogenBioClinicaMayo Foundation for Medical Education and ResearchElsie and Marvin Dekelboum Family FoundationHope Center for Neurological DisordersWellcome TrustUniversity of Southern CaliforniaMayo ClinicU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of Health and Human ServicesAvid RadiopharmaceuticalsArizona Department of Health ServicesMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchArizona Biomedical Research CommissionFoundation for the National Institutes of HealthAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilMeso Scale Diagnostics
Mots-clésEndophenotypeNeuroscienceAmyloid betaAlzheimer's diseaseGenetic architectureTau proteinPositron emission tomographyGenome-wide association studyDiseasePsychologyLocus (genetics)BiologyMedicineBioinformaticsGeneticsCognitionGeneInternal medicineQuantitative trait locusGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Determining the genetic architecture of Alzheimer's disease pathologies can enhance mechanistic understanding and inform precision medicine strategies. Here, we perform a genome-wide association study of cortical tau quantified by positron emission tomography in 3046 participants from 12 independent studies. The CYP1B1-RMDN2 locus is associated with tau deposition. The most significant signal is at rs2113389, explaining 4.3% of the variation in cortical tau, while APOE4 rs429358 accounts for 3.6%. rs2113389 is associated with higher tau and faster cognitive decline. Additive effects, but no interactions, are observed between rs2113389 and diagnosis, APOE4, and amyloid beta positivity. CYP1B1 expression is upregulated in AD. rs2113389 is associated with higher CYP1B1 expression and methylation levels. Mouse model studies provide additional functional evidence for a relationship between CYP1B1 and tau deposition but not amyloid beta. These results provide insight into the genetic basis of cerebral tau deposition and support novel pathways for therapeutic development in AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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