Longitudinal changes in epigenetic clocks predict survival in the InCHIANTI cohort
Notice bibliographique
Résumé
Abstracts Importance Cross-sectional assessment of epigenetic clocks provides information on the pace of aging. Whether longitudinal acceleration or deceleration of epigenetic clocks over time provides additional mortality prediction is unknown. Objective To test the independent associations of baseline levels and longitudinal changes in epigenetic clocks with mortality Design Longitudinal study Setting InCHIANTI, a population-based study of community dwelling individuals in Tuscany, Italy. Participants 699 InCHIANTI study participants aged 21-95 years at baseline with longitudinal measurements of DNA methylation. Exposure Baseline levels and longitudinal changes in seven epigenetic clocks, including two first-generation clocks developed using chronological age for reference (Hannum Clock, Horvath Clock), three second-generation clocks developed using time-to-death for references (DNAmPhenoAge, DNAmGrimAge, DNAmGrimAge Version 2), and two third-generation clocks developed using longitudinal rate of change of multiple phenotypes for reference (DunedinPOAm_38, DunedinPACE). Main Outcomes and Measures Mortality was the primary outcome. Cox regression was used to estimate independent associations of baseline and longitudinal changes in epigenetic clocks with mortality. Results Adjusting for age, sex, study sites, and epigenetic clock at the baseline, longitudinal changes of the following epigenetic clocks were associated with mortality: Hannum clock (aHR = 1.14, 95% CI:[1.03, 1.26]), DNAmPhenoAge (aHR = 1.23, 95% CI: [1.10,1.37]), DNAmGrimAge (aHR = 1.13, 95% CI: [1.02,1.26]), DNAmGrimAge Version 2 (aHR = 1.18, 95% CI:[1.06,1.31]), and DunedinPOAm_38 (aHR = 1.15, 95%CI: [1.01,1.30]). Conclusions and Relevance Our findings confirm that epigenetic clocks capture a dimension of health that is predictive of mortality and add the notion that time changes of epigenetic age reflect changes in health that additionally and independently contribute to mortality prediction. Future studies should test whether interventions that slow down the rate of epigenetic aging are associated with longer healthspan and lifespan. Key Points Question: Is the rate of change in epigenetic clock associated with differential mortality? Findings: In 699 adults with followed for up to 24 years, faster longitudinal changes in epigenetic clocks (Hannum clock, DNAmPhenoAge, DNAmGrimAge, DNAmGrimAge version 2, DunedinPOAm_38, DunedinPACE) were significantly associated with higher mortality, independent of baseline epigenetic age and other confounders. Meaning: Independent of chronological age, epigenetic clock and change over time of epigenetic clock independently predicted the risk of death. Interventions that slow down the pace of epigenetic aging may enhance healthy longevity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».