MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402722290 · doi:10.1101/2024.09.20.614127

Functional characterization of N-acetyltransferase 10 (NAT10) in Leishmania mexicana

2024· preprint· en· W4402722290 sur OpenAlexaff
Suellen Rodrigues Maran, Ariely Barbosa Leite, Gabriela Gomes Alves, Bruno Souza Bonifácio, Carlos Eduardo Gomes Alves, Paulo Otávio Lourenço Moreira, Giovanna Marques Panessa, Angelica Montero do Amaral Prado, José Renato Rosa Cussiol, Katlin B. Massirer, Tiago Rodrigues Ferreira, David L. Sacks, C. Barbieri, Marcelo S. da Silva, Rubens Lima do Monte‐Neto, Nilmar Silvio Moretti

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueChemical Reactions and Isotopes
Établissements canadiensCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésLeishmania mexicanaAcetyltransferaseLeishmaniaCell biologyCharacterization (materials science)BiologyChemistryBiochemistryComputer scienceNanotechnologyMaterials scienceAcetylationParasite hostingGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Leishmania presents a complex life cycle that involves both invertebrate and vertebrate hosts. By regulating gene expression, protein synthesis, and metabolism, the parasite can adapt to various environmental conditions. This regulation occurs mainly at the post-transcriptional level and may involve epitranscriptomic modifications of RNAs. Recent studies have shown that mRNAs in humans undergo a modification known as N4-acetylcytidine (ac4C) catalyzed by the enzyme N-acetyltransferase (NAT10), impacting mRNAs stability and translation. Here, we characterized the NAT10 homologue of L. mexicana , finding that the enzyme exhibits all the conserved acetyltransferase domains and although failed to functionally complement the Kre33 mutant in Saccharomyces cerevisia e, has in vitro acetyltransferase activity. We also discovered that LmexNAT10 is nuclear, and seems essential, as evidenced by unsuccessful attempts to obtain null mutant parasites. Phenotypic characterization of single-knockout parasites revealed that LmexNAT10 affects the multiplication of procyclic forms and the promastigote-amastigote differentiation. Additionally, in vivo infection studies using the invertebrate vector Lutzomyia longipalpis showed a delay in the parasite differentiation into metacyclics. Finally, we observed changes in the cell cycle progression and protein synthesis in the mutant parasites. Together, these results suggest that LmexNAT10 might be important for parasite differentiation, potentially by regulating ac4C levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetChemical Reactions and IsotopesTravaux en français237 207