MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402833817 · doi:10.1080/00268976.2024.2407538

Computational investigation of hydrazone derivatives as potential COVID-19 receptor inhibitors: DFT analysis, molecular docking, dynamics simulations, topological indices and ADMET profiling

2024· article· en· W4402833817 sur OpenAlexaff
S. Sonadevi, D. Rajaraman, M. Saritha, A. Dhandapani, Peter Solo, Tony Augustine, Jain Maria Thomas, L. Athishu Anthony

Notice bibliographique

RevueMolecular Physics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSynthesis and biological activity
Établissements canadiensSt. Peter's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular dynamicsDocking (animal)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Profiling (computer programming)Computational chemistryChemistryComputational biologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)BiologyComputer scienceMedicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A molecule (E)-N′-((E)-2-(2-(furan-3-carbonyl)hydrazono)-1,2-diphenylethylidene) furan-2-carbohydrazide (DPFC) plays a significant role in the treatment of SARS-CoV-2. The current study investigated the molecular structure of the titled compound through a DFT method. The geometric parameters obtained theoretically closely match experimental findings. Various calculations were conducted, including dipole moment, polarizability, hyperpolarizability (NLO), occupied and unoccupied molecular orbitals (HOMO-LUMO), charge localisation and delocalisation (NBO), molecular stability, and the chemical activity region (MEP) of the molecule. The interaction between the DPFC ligand and COVID-19 receptors (6WCF/6Y84/6LU7) was investigated through molecular docking to elucidate the binding modes of this compound at the active sites. Molecular dynamics simulation was employed on the COVID-19 main protease (Mpro: 6WCF/6Y84/6LU7) to discern the factors influencing the inhibitory effect and the stability of interaction under dynamic conditions. Molecular descriptors play a significant role in molecular structural analysis by investigating quantitative structure-activity relationships (QSARs) and quantitative structure-property relationships (QSPRs).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,170
Score d'incertitude au seuil0,704

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular PhysicsMême sujetSynthesis and biological activityTravaux en français237 207